[发明专利]用三重复合免疫捕获RT-PCR同步检测百合三种病毒的方法有效
申请号: | 201610210127.5 | 申请日: | 2016-04-07 |
公开(公告)号: | CN105755173B | 公开(公告)日: | 2019-10-25 |
发明(设计)人: | 张玉宝;王亚军;谢忠奎;王若愚;郭志鸿;杨果;邱阳 | 申请(专利权)人: | 中国科学院寒区旱区环境与工程研究所;徐州沐阳生物科技发展有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6804 |
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地址: | 730000 *** | 国省代码: | 甘肃;62 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 免疫 捕获 三重 rt pcr 同步 检测 百合 病毒 方法 | ||
1.一种用三重复合免疫捕获RT-PCR同步检测百合隐症病毒LSV、斑驳病毒LMoV和黄瓜花叶病毒CMV的方法,其特征在于,包括以下步骤:
①引物设计
根据LSV、LMoV和CMV的CP基因序列, 设计LSV、LMoV和CMV的特异性正向和反向引物,扩增LSV、LMoV和CMV目的片段的大小分别为198bp、395bp和248bp;其中LSV、LMoV和CMV的特异性正向和反向引物序列为:
LSV-F: 5’- TATGGGCTTCCA ATACAAC-3’
LSV-R: 5’-TATTCGGTTTCCAGGTTC -3’
LMoV-F : 5’- TGGCACCTCACCAAATGTA-3’
LMoV-R: 5’- CATCATCTGCTGTATGCCTCT-3’
CMV-F: 5’- CTTTGTAGGGAGTGAACGCTGTA -3’
CMV-R: 5’-AGATGGCGGCAACGGATA -3’;
②三重复合免疫捕获
1)取100mg复合感染LSV+LMoV+CMV的组织,加1mL PBST研磨后将研磨液转入1.5mL灭菌离心管中,4000rpm离心2min,上清液即感病组织粗提液;
2)用pH 9.6的碳酸盐缓冲液将LMoV、LSV和CMV多克隆抗体稀释后混合,使LMoV、LSV和CMV三种抗体的终浓度分别为1μg/mL、10μg/mL和50μg/mL,取200μL上述稀释的混合抗体加入PCR管,37℃孵育2h;
3)弃去步骤2)中三种抗体的包被混合液,用PBST洗3次,每次3min; 加入200μL感病组织粗提液,37℃孵育3h;
4)弃去步骤3)中的感病组织粗提液,用PBST洗3次,ddH2O洗1次,短暂离心,吸去残液;
③三重RT-PCR
1) 在包被过的PCR管中分别加入10 μmol/L的LSV、LMoV和CMV特异性反向引物LSV-R、LMoV-R和CMV-R各2μL以及ddH2O 6μL,混合后于70℃保温10min,之后迅速冰浴2 min;
2)三重RT:向上述PCR管中分别加入5×M-MLV buffer 4μL、10mmol/L 的dNTP混合物2μL、30U/μL的RNase抑制剂0.68μL、200U /μL 的M-MLV反转录酶0.70μL以及DEPC-H2O 0.62μL,混合均匀后,42℃水浴1h,70℃保温15 min,得到三种病毒的cDNAs混合物;
3)三重PCR: 取一新的PCR管,分别加入上述步骤2)中三种病毒的cDNAs混合物2.0μL、10×PCR buffer 2.5μL、25 mmol/L 的MgCl2 2.5μL、2.5mmol/L 的dNTP混合物2.5μL、10μmol/L 的LSV特异性正向和反向引物LSV-F 和LSV-R 各0.5μL、10μmol/L 的LMoV特异性正向和反向引物LMoV-F 和LMoV-R 各0.5μL、10μmol/L 的CMV特异性正向和反向引物CMV-F和CMV-R 各0.5μL、5U/μL的
④电泳检测
三重PCR反应结束后取10μL反应产物进行2.0%琼脂糖凝胶电泳,在1×TBE缓冲液环境中,100V稳压电泳40min,然后用凝胶成像系统观察并记录结果,LSV、LMoV和CMV三种病毒核酸片段的电泳条带分别出现在198bp、395bp和248bp处;
⑤结果分析
根据电泳胶上扩增条带的有无及其大小判定所检测的样品是否感染LSV、LMoV或CMV,若凝胶中仅存在198bp的核酸片段则说明样品中含有LSV;若凝胶中仅存在395bp的核酸片段则说明样品中含有LMoV;若凝胶中仅存在248bp的核酸片段则说明样品中含有CMV;若凝胶中同时存在198bp和395bp的核酸片段,则说明样品中同时含有LSV和LMoV;若凝胶中同时存在198bp和248bp的核酸片段,则说明样品中同时含有LSV和CMV;若凝胶中同时存在198bp、395bp和248bp的核酸片段,则说明样品中同时含有LSV、LMoV和CMV。
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