[发明专利]RNAG-四链体的检测方法在审
申请号: | 201610218094.9 | 申请日: | 2016-04-08 |
公开(公告)号: | CN107271377A | 公开(公告)日: | 2017-10-20 |
发明(设计)人: | 唐亚林;许淑娟;李骞 | 申请(专利权)人: | 中国科学院化学研究所 |
主分类号: | G01N21/31 | 分类号: | G01N21/31;G01N21/64 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙)11201 | 代理人: | 李志东 |
地址: | 100190 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | rnag 四链体 检测 方法 | ||
1.一种确定待测样品中是否存在RNA G-四链体的方法,其特征在于,包括:
(1)将待测样品与硫磺素T接触,以便得到混合溶液,所述待测样品被预先确定含有RNA;
(2)对所述混合溶液进行紫外-可见吸收光谱分析;
(3)基于所述紫外-可见吸收光谱分析结果,确定所述待测样品中是否存在RNA G-四链体,
其中,所述紫外-可见吸收光谱分析结果中硫磺素T的最大吸收峰位置在424~544nm是所述待测样品中含有RNA G-四链体的指示;
步骤(1)进一步包括:
将所述待测样品溶解在Tris缓冲液中,以便获得溶液A;
将所述硫磺素T、高纯水和Tris缓冲液混合,以便获得溶液B;
将所述溶液A和溶液B混合并在避光条件下反应4~8小时,以便获得所述混合溶液,其中,所述混合溶液中RNA与所述硫磺素T的分子摩尔比为0.5~4,
所述Tris缓冲液含有钾离子,所述钾离子的浓度是40mM,所述Tris缓冲液pH为7.0~8.0。
2.一种确定待测样品中是否存在RNA G-四链体的方法,其特征在于,包括:
(1)将待测样品与硫磺素T接触,以便得到混合溶液,所述待测样品被预先确定含有RNA;
(2)对所述混合溶液进行荧光强度分析;以及
(3)基于所述荧光强度分析结果,确定所述待测样品中是否存在RNA G-四链体,其中,所述荧光强度分析结果中硫磺素T荧光特征峰强度与预定参数相比高100~600倍是所述待测样品中含有RNAG-四链体的指示,
所述预定参数是利用硫磺素T进行空白对照试验所确定的,
其中,所述硫磺素T荧光特征峰位置在480nm~512nm;
步骤(1)进一步包括:
将所述待测样品溶解在Tris缓冲液中,以便获得溶液A;
将所述硫磺素T、高纯水和Tris缓冲液混合,以便获得溶液B;
将所述溶液A和溶液B混合并在避光条件下反应4~8小时,以便获得所述混合溶液,其中,所述混合溶液中RNA与所述硫磺素T的分子摩尔比为0.5~4,
所述Tris缓冲液含有钾离子,所述钾离子的浓度是40mM,所述Tris缓冲液pH为7.0~8.0。
3.一种确定待测样品中是否存在RNA G-四链体的方法,其特征在于,包括:
(1)将待测样品与硫磺素T接触,以便得到混合溶液,所述待测样品被预先确定含有RNA;
(2)对所述混合溶液进行荧光寿命分析;以及
(3)基于所述荧光寿命分析结果,确定所述待测样品中是否存在RNA G-四链体,其中,所述荧光寿命分析结果中硫磺素T的荧光寿命值达到纳秒级别是所述待测样品中含有RNAG-四链体的指示,
其中利用硫磺素T进行空白对照试验确定的硫磺素T的荧光寿命在皮秒级别;
步骤(1)进一步包括:
将所述待测样品溶解在Tris缓冲液中,以便获得溶液A;
将所述硫磺素T、与高纯水和Tris缓冲液混合,以便获得溶液B;
将所述溶液A和溶液B混合并在避光条件下反应4~8小时,以便获得所述混合溶液,其中,所述混合溶液中RNA与所述硫磺素T的分子摩尔比为0.5~4,
所述Tris缓冲液含有钾离子,所述钾离子的浓度是40mM,所述Tris缓冲液pH为7.0~8.0。
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