[发明专利]绿豆抗豆象基因VrPGIP、其功能性分子标记及应用有效
申请号: | 201610224823.1 | 申请日: | 2016-04-12 |
公开(公告)号: | CN105861516B | 公开(公告)日: | 2019-07-12 |
发明(设计)人: | 陈红霖;程须珍;王丽侠;王素华 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院作物科学研究所 |
主分类号: | C12N15/29 | 分类号: | C12N15/29;A01H5/00;C12N15/11;C12Q1/6895 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 王文君 |
地址: | 100081 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 绿豆 基因 功能性分子标记 生物信息学分析 染色体步移 分子育种 候选基因 基因资源 经济损失 克隆测序 物理距离 有效控制 育种手段 重要意义 染色体 虫害 应用 育种 成功 开发 | ||
1.绿豆抗豆象基因VrPGIP,其特征在于,基因VrPGIP的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。
2.含有权利要求1所述基因VrPGIP的载体或工程菌。
3.权利要求1所述基因VrPGIP在绿豆资源抗豆象分子育种中的应用。
4.绿豆抗豆象基因VrPGIP的功能性分子标记,其特征在于,所述功能性分子标记包括6个SNP位点,其中有3个SNP位点引起氨基酸变化,分别位于绿豆抗豆象基因VrPGIP序列的第958、995和1003位碱基,上述三个位点的碱基分别为G、T和A的绿豆为感豆象品种,上述三个位点的碱基分别为T、C和C的绿豆为抗豆象品种;
所述功能性分子标记的序列如SEQ ID NO:6所示。
5.用于检测权利要求4所述功能性分子标记的引物,其特征在于,包括正向引物F5’-ACAGGGTGGGGAATTGCATA-3’和反向引物R5'-GAGGGCGGAAGTAGAGAGAC-3'。
6.含有权利要求5所述引物的用于鉴定绿豆抗豆象品种的PCR检测试剂盒。
7.权利要求4所述功能性分子标记在鉴定绿豆抗豆象品种中的应用。
8.根据权利要求7所述的应用,其特征在于,包括以下步骤:
1)提取待测绿豆的DNA;
2)以DNA作为模板,利用扩增所述功能性分子标记的引物,通过PCR反应扩增出绿豆抗豆象基因VrPGIP大小为169bp的DNA片段;
3)检测PCR扩增产物,如果扩增产物序列中第35、72和80位碱基分别为T、C和C,则待测绿豆为抗豆象品种;
其中,步骤2)中使用的引物,其序列同权利要求5所述。
9.根据权利要求8所述的应用,其特征在于,
PCR反应体系:40ng DNA,1×Taq酶缓冲液,1mmol L-1dNTPs,正、反向引物各0.25μmolL-1和1U Taq DNA聚合酶,ddH2O补至10μl;其中,1×Taq酶缓冲液的组成如下:10mmol L-1Tris-HCl,pH8.8;10mmol L-1KCl;10mmol L-1(NH4)2SO4;1.5mmol L-1MgCl2;0.1%Triton X-100;
反应程序:95℃预变性5min;95℃变性30s,55℃退火45s,72℃延伸45s,32~35个循环;最后72℃延伸5min。
10.权利要求4所述功能性分子标记在绿豆分子标记辅助育种中的应用。
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