[发明专利]重组核酸片段RecCR010005及其检测引物与应用

说明书

本发明涉及分子生物学，具体公开了一种水稻抗稻瘟病重组核酸片段RecCR010005及其检测引物与应用。本发明还提供一种基于全基因组选择育种技术选育含有抗稻瘟病基因组重组核酸片段的水稻植株的方法，将目标基因组片段导入受体材料，并同时实现背景的回复。本发明改良的受体材料为‘深95B’，是广泛使用的不育系‘深95A’配套使用的保持系，利用上述方法，可以在保留‘深95B’原有优点的情况下，导入稻瘟病抗性基因组片段，提高其稻瘟病抗性。本发明提供的重组核酸片段与稻瘟病抗性紧密相关，可作为抗性资源应用于其他品种的培育。

技术领域

本发明涉及分子生物学，具体地说，涉及一种水稻抗稻瘟病重组核酸片段。

背景技术

长期以来，传统育种的选择方法主要依赖于田间表现型的评价，根据育种家个人经验进行取舍，其最大的缺点在于耗时长，效率较低。要提高选择的效率，最理想的方法应是能够直接对基因型进行选择。随着分子生物技术的发展，分子标记为实现对基因型的直接选择提供了可能。近年来，已开始应用分子标记辅助选择方法来改良个别目标性状，能够显著的缩短育种年限。

稻瘟病是水稻最严重的病害之一，全球每年由稻瘟病引起的水稻产量损失占11％～30％，因此稻瘟病及其抗性的研究显得尤为重要。随着对稻瘟病研究的逐步深入，许多水稻抗稻瘟病基因DNA片段相继被定位和克隆。其中，Pi1及Pik簇等位基因定位于水稻第11染色体长臂近末端区域(Hua等，Theoretical and Applied Genetics.2012,125:1047-1055；Li等，Molecular Breeding.2007,20:179-188；Alok等，FunctionalIntegrativeGenomics.2012,12:215-228；Yuan等，Theoretical and Applied Genetics.2011,122:1017-1028)。

为了提高育种的稳定性、缩短育种过程和时间、有效利用水稻抗性资源，有必要对水稻在杂交育种中产生的稻瘟病抗性基因重组片段进行研究，为能够高效稳定的实现水稻抗性育种提供有效手段。

发明内容

为了解决现有技术中存在的问题，本发明的目的是提供一种水稻抗稻瘟病重组核酸片段RecCR010005及其检测引物与应用。

为了实现本发明目的，本发明的技术方案如下：

第一方面，本发明提供一种重组核酸片段，其特征在于，其核苷酸序列包含SEQ IDNO.1所示142-186bp的序列或其片段、或其变体、或其互补序列。

作为优选，其核苷酸序列包含SEQ ID NO.1所示的序列或其片段、或其变体、或其互补序列。SEQ ID NO.1所示的序列来自于‘深95B’和‘华3418B’基因组区域交换产生的重组植株。

一般来讲，特定核苷酸序列的变体将与该特定核苷酸序列具有至少约70％、75％、80％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％或更高的序列同一性，或以上的互补序列。这样的变体序列包括一个或多个核酸残基的添加、缺失或替换，从而可以导致相应的氨基酸残基的添加、移除或替换。通过本领域内已知的序列比对程序包括杂交技术确定序列同一性。实施方案的核苷酸序列变体与本发明的序列的差异可以少至1-15个核苷酸、少至1-10个(例如6-10个)，少至5个，少至4、3、2或甚至1个核苷酸。

第二方面，本发明提供了用于扩增所述重组核酸片段的引物。

所述引物包括本领域技术人员针对该扩增目标可设计得到的所有引物。

当扩增目标为SEQ ID NO.1所示序列时，所述引物可选自：