[发明专利]一种以组织蛋白酶D为靶点的小分子抑制剂的筛选方法

权利要求书

1.一种以组织蛋白酶D为靶点的小分子抑制剂的筛选方法，其特征在于，其包括步骤：

(1)组织蛋白酶D三维结构的获取、分析及处理；

(2)建立对接用小分子配体库；

(3)计算机虚拟筛选系统的构建；

(4)运用步骤(3)的计算机虚拟筛选系统对步骤(2)中的小分子配体库进行筛选；

(5)生物活性测试。

2.如权利要求1所述的以组织蛋白酶D为靶点的小分子抑制剂的筛选方法，其特征在于，所述步骤(1)中，在蛋白数据库(http://www.rcsb.org)中搜寻并获得组织蛋白酶D蛋白的三维结构(PDB code：1LYB),该结构为组织蛋白酶D蛋白与其抑制剂Pepstatin A的复合物；使用薛定谔软件包中maestro 10.1(2015-01，version 10.1,http://www.)的Protein preparation wizard模块进行准备，其中，首先对蛋白进行加氢，并删除蛋白中的水分子、α-甘露糖、β-甘露糖、N-乙酰-D-葡萄糖胺，然后在OPLS2005力场条件下对蛋白进行能量优化，最终晶体结构中重原子RMSD小于

3.如权利要求1所述的以组织蛋白酶D为靶点的小分子抑制剂的筛选方法，其特征在于，所述步骤(2)的建立对接用小分子配体库中；小分子结构specs 2015 10mg数据库中获取，并滤除分子量大于650Da和小于200Da的分子，然后使用薛定谔软件包中maestro 10.1的Ligprep模块对配体进行优化。

4.如权利要求1所述的以组织蛋白酶D为靶点的小分子抑制剂的筛选方法，其特征在于，所述步骤(3)中，使用薛定谔软件以配体PepstatinA作为格点盒子的中心生成格点文件，盒子大小为生成虚拟筛选用的格点文件。

5.如权利要求1所述的以组织蛋白酶D为靶点的小分子抑制剂的筛选方法，其特征在于，所述步骤(4)中，将准备的小分子配体与靶蛋白进行对接，首先选用薛定谔软件包中maestro 10.1里Glide的HTVS(high-throughput virtual screening)模式进行初筛,并选取打分前10％的化合物用SP(standard precision)模式进行复筛,然后根据打分选取前5％的化合物用XP(extra precision)模式进行精筛.，最后根据打分、配体的结合构象、结构多样性对化合物进行挑选，并筛选出具有cathepsin D抑制活性的化合物。

6.如权利要求1或6所述的以组织蛋白酶D为靶点的小分子抑制剂的筛选方法，其特征在于，筛选的具有cathepsin D抑制活性的化合物为：

化合物-1，

化合物-2，

化合物-3，

化合物-4，

化合物-5，

化合物-6，