[发明专利]一种利用LAMP技术检测植物组织中茄科青枯菌的方法有效
申请号: | 201610312802.5 | 申请日: | 2016-05-11 |
公开(公告)号: | CN105779631B | 公开(公告)日: | 2018-03-02 |
发明(设计)人: | 佘小漫;何自福;汤亚飞;蓝国兵 | 申请(专利权)人: | 广东省农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6844;C12Q1/04;C12R1/01 |
代理公司: | 广州市华学知识产权代理有限公司44245 | 代理人: | 苏运贞,裘晖 |
地址: | 510640 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 利用 lamp 技术 检测 植物 组织 中茄科青枯菌 方法 | ||
1.一种利用LAMP技术检测植物组织中茄科青枯菌的方法,其特征在于包括如下步骤:
(1)环介导等温扩增茄科青枯菌引物设计:选取茄科青枯菌的特异基因hrpB,设计适合环介导等温扩增的引物FIP、F3、BIP、B3和环引物LoopF;
FIP:5’-CGCGTAGTCGTCGGACTTTCC-CCGTGCGTATCAGCTCGT-3’;
F3:5’-TTTCGCCGCTGATTTCGA-3’;
BIP:5’-AGTGCGATGAAGAAGCGGAAGA-CAGCTGGTCATCCGAATGG-3’;
B3:5’-CTGCCAGCCGGTATTGC-3’;
LoopF:5’-TCGCTGGGAGGAGTGGT-3’;
(2)检测病样品的准备:取待检病样的茎基部和根部,用水冲洗干净,取含有维管束的病组织;
(3)青枯菌悬浮液制备:用灭菌的镊子将步骤(2)中获取的病组织放入灭菌容器中,加入灭菌水,静置,得到待检病样品悬浮液;
(4)环介导等温扩增法反应:以步骤(3)获得的待检病样品悬浮液为模板,用步骤(1)的引物进行LAMP反应;
(5)鉴别结果:通过肉眼观察环介导等温扩增的反应产物,如反应产物为绿色的浑浊液体,即确认病样中含有茄科青枯菌;如反应产物为橙色透明液体,则表明病样不含有茄科青枯菌;
步骤(4)中所述的LAMP反应的反应条件为62℃恒温1h,95℃恒温2min。
2.根据权利要求1所述利用LAMP技术检测植物组织中茄科青枯菌的方法,其特征在于:
步骤(2)中所述的病组织的大小为2~3mm×3~4mm;
步骤(3)中所述的灭菌水的用量为大小为2~3mm×3~4mm的病组织配比500μL灭菌水。
3.根据权利要求1所述利用LAMP技术检测植物组织中茄科青枯菌的方法,其特征在于:所述的静置的时间为10~20分钟。
4.根据权利要求3所述利用LAMP技术检测植物组织中茄科青枯菌的方法,其特征在于:所述的静置的时间为15分钟。
5.根据权利要求1所述利用LAMP技术检测植物组织中茄科青枯菌的方法,其特征在于:
步骤(4)中所述的LAMP反应的反应体系如下:每25μL反应体积中,含1μL待检病样品悬浮液、12.5μL 2×反应缓冲液、浓度为50μM的引物FIP和BIP各2μL、浓度为50μM的引物LoopF 1μL、浓度为50μM的引物F3和B3各0.5μL、Bst DN聚合酶1μL、荧光目测反应液1μL,去离子水补足至25μL;
所述的2×反应缓冲液的组成如下:40mM、pH8.8的Tris-HCl,浓度为20mM的KCl、浓度为16mM的MgSO4、浓度为20mM的(NH4)2SO4、浓度为体积百分比0.2%的Tween-20、浓度为1.6M的甜菜碱、浓度为2.8mM的dNTPs。
6.根据权利要求1所述利用LAMP技术检测植物组织中茄科青枯菌的方法,其特征在于:所述的植物为茄子、番茄、烟草、马铃薯、辣椒、花生、沙姜、生姜和甘薯中的一种以上。
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