[发明专利]一种基于高通量测序和代谢产物导向的微生物分离方法有效
申请号: | 201610512694.6 | 申请日: | 2016-06-30 |
公开(公告)号: | CN107586834B | 公开(公告)日: | 2021-07-27 |
发明(设计)人: | 杜海;徐岩 | 申请(专利权)人: | 江南大学 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;C12Q1/04;C12N1/02;G16B30/00;G16B40/00 |
代理公司: | 哈尔滨市阳光惠远知识产权代理有限公司 23211 | 代理人: | 耿晓岳 |
地址: | 214122 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 通量 代谢 产物 导向 微生物 分离 方法 | ||
1.一种基于代谢产物导向的微生物分离方法,其特征在于,所述方法包括:提取数个复杂微生物样品的基因组、采用高通量测序技术分别获取各样品的微生物群落信息,获得各样品的微生物菌群结构的定性和相对定量信息,并分析各样品的目标代谢产物含量,然后用EXCEL的CORREL函数分析技术和CCA分析技术分析微生物属种与目标代谢产物的相关性,得到与目标代谢产物相关性系数相对较高的1种或者多种微生物属种,即得到了与复杂微生物样品中目标代谢产物密切相关的微生物属种;再根据与目标风味产物相关性系数相对较高的微生物属种制定相应的分离策略;所述代谢产物为是4-甲基苯酚;所述的用EXCEL的CORREL函数分析技术和CCA分析技术分析微生物属种与目标代谢产物的相关性,具体是指:
(1)先用EXCEL的CORREL函数分析高通量测序技术得到的样品中微生物的属种与样品中目标代谢产物的相关性,得到相关性系数相对较高的1个或者多个微生物的属种名称;
(2)将目标代谢产物含量不同的样品接种于富集培养基中进行发酵培养;所述富集培养基为己酸菌培养基:酵母膏 5g·L-1,蛋白胨 5g·L-1,乙酸钠 6g·L-1,磷酸氢二钾0.4g·L-1,硫酸镁0.2g·L-1,硫酸铵 0.5g·L-1,碳酸钙 5g·L-1,磷酸氢二钾 1g·L-1,磷酸二氢钾 0.5g·L-1,乙醇 20 mL;
发酵结束后测定发酵液中目标风味物质的含量,选取目标代谢产物产量差异相对较大的发酵液作为代表性样品,提取基因组,通过高通量测序技术得到所述代表性样品中微生物的属种和含量,然后将目标代谢产物和目标代谢产物含量最大的发酵液中的菌体含量靠前的微生物属种看作环境因子,做CCA分析,即得到与目标代谢产物相关性系数相对较高的1种或者多种微生物属种。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述制定相应的分离策略,是指采用适合与目标代谢产物相关性系数相对较高的微生物属种的相应的培养基进行培养。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述复杂微生物样品为污水、土壤、窖泥、排泄物。
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