[发明专利]一种基于复合PCR技术的大蒜中致病菌定性检测的方法在审

专利信息
申请号: 201610613348.7 申请日: 2016-07-26
公开(公告)号: CN107653334A 公开(公告)日: 2018-02-02
发明(设计)人: 兰青阔;阎瑞香;赵新;王成;朱志强;陈锐;王庆平;王永 申请(专利权)人: 天津市农业质量标准与检测技术研究所;国家农产品保鲜工程技术研究中心
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/686;C12Q1/04;C12N15/11
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 300192 *** 国省代码: 天津;12
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 复合 pcr 技术 大蒜 致病菌 定性 检测 方法
【权利要求书】:

1.用于鉴定大蒜中常见致病菌的1套复合PCR引物引物,其特征在于,包括4对引物,分别为:

用于检测灰葡萄孢霉菌B.cinerea Pers的1对引物:上游引物序列B.c-F:5’-ATTTGGCTTCGCTGCTGT-3’,下游引物序列B.c-R:5’-GCGGTGGTATCTCGCTCT-3’,PCR产物大小162bp;

用于检测葱鳞葡萄孢霉菌B.squamosa Walker的1对引物,上游引物序列B.s-F:5’-ATACTCCGCCATTAGCCC-3’,下游引物序列B.s-R:5’-GCCGCCAACGATCTCAAA-3’,PCR产物大小244bp;

用于检测链格孢菌Alternaria alternata的1对引物,上游引物序列A.a-F:5’-TGACCCGCACATACAACT-3’,下游引物序列A.a-R:5’-CAACCACCTTTCCAGAGCPCR-3’,产物大小380bp;

用于检测胶孢炭疽菌Colletotrichum gloeosporioides(penz.)sacc.的1对引物,上游引物序列C.g-F:5’-CGGCTAGAACAGGACATT-3’,下游引物序列C.g-R:5’-CAGAAGTTGGGGATTGAC-3’,PCR产物大小455bp。

2.一种采用权利要求1所述引物,基于复合PCR技术的大蒜中致病菌的检测方法,其特征在于包括如下步骤:

(1)使用微生物DNA提取试剂盒,提取大蒜中附着和增殖的微生物基因组DNA,为供试品DNA模板,稀释至50ng/μL备用。

(2)采用权利要求1所述的复合PCR引物,对供试品DNA模板进行PCR扩增,其中的PCR扩增反应的总体积为20μL,扩增反应体系为: Master Mix 5μL,4对引物上游和下游引物10μmol/L各0.2μL,供试品DNA模板(50ng/μL)1μL,双蒸水补足20μL;PCR反应程序为94℃预变性5min,35个扩增循环(94℃30sec,55℃20sec,72℃45sec);72℃延伸7min。

(3)按20g/L的质量浓度制备琼脂糖溶液。取12μL PCR产物加入凝胶点样孔,同时在其中一个点样孔中加入DNA分子量标准,接通电源在2V/cm~5V/cm条件下电泳检测。电泳结束后,置于凝胶成像仪上或紫外透射仪上成像。

(4)凝胶成像后,依据DNA分子量标准计算供试品PCR产物大小,依据电泳条带大小判断致病菌检出情况,其中162bp、244bp、380bp和455bp处条带分别代表检出灰葡萄孢霉菌、葱鳞葡萄孢霉菌、链格孢菌和胶孢炭疽菌。

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