[发明专利]检测癌症的存在风险的方法

权利要求书

1.一种检测癌症的存在风险的方法，其步骤包含：

从受试者取得包含核酸的体液的检体样本；

测量癌症基因标记组的mRNA表达量，该癌症基因标记组是由β-球蛋白、糖化血红蛋白、细胞激素讯息抑制物-3、肾上腺髓质素、分泌型白细胞蛋白酶抑制蛋白、表面抗原分化簇68、S100钙结合蛋白P、DNA损伤诱导转移因子3、组织蛋白酶Z、Bcl-2相关X蛋白、淀粉样蛋白前驱蛋白、转酮醇酵酶、G蛋白偶联雌激素受体、血红素结合蛋白以及血红素结合蛋白相关蛋白、FK506结合蛋白3、酸性磷酸酶5、溶酶体关联蛋白跨膜4alpha以及趋化因子受体4所组成；

计算该受试者的癌症风险指数，其公式为sum[LN(个别基因表现量/个别基因的基础表达量)]，包含：

(i)取一个别基因表达量除以一个别基因的基础表达量以计算出每个基因的表达倍率；

(ii)再将倍率取自然对数使上升倍数或下降倍数有相同的权重；

(iii)基因表达量上升者确认有癌症的存在风险，基因表达量下降者不予考虑；以及

(iv)加总个体基因表达上升者所属权重即为受试者的癌症风险指数；

该个别基因的基础表达量是取自非癌症控制组的含核酸的体液的检体样本的相对应癌症基因的表达量的几何平均数；以及

以步骤(c)计算非癌症控制组的癌症风险指数；

其中基于该受试者的癌症风险指数低于该非癌症控制组的癌症风险指数的中位数者，是代表该受试者具有形成癌症的低风险；基于该受试者的癌症风险指数高于该非癌症控制组的癌症风险指数99％可信区间者，代表该受试者具有形成癌症的高风险。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述步骤(b)是经由微数组芯片、实时聚合酶链锁反应、Northern印记杂交法或原位杂交量测。

3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述癌症是为乳癌、胃癌、膀胱癌或肝癌。

4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述检体样本是为外周血单核细胞样本。

5.一种评估一患者对癌症治疗的预后复发风险的方法，其步骤包含：

从患者取得包含核酸的体液的检体样本；

测量癌症基因标记组的mRNA表达量，该癌症基因标记组是由β-球蛋白、糖化血红蛋白、细胞激素讯息抑制物-3、肾上腺髓质素、分泌型白细胞蛋白酶抑制蛋白、表面抗原分化簇68、S100钙结合蛋白P、DNA损伤诱导转移因子3、组织蛋白酶Z、Bcl-2相关X蛋白、淀粉样蛋白前驱蛋白、转酮醇酵酶、G蛋白偶联雌激素受体、血红素结合蛋白以及血红素结合蛋白相关蛋白、FK506结合蛋白3、酸性磷酸酶5、溶酶体关联蛋白跨膜4alpha以及趋化因子受体所组成；

计算该患者的癌症风险指数，其公式为

sum[LN(个别基因表达量/个别基因的基础表达量)]，包含：

(i)取一个别基因表达量除以一个别基因的基础表达量以计算出每个基因的表达倍率；

(ii)再将倍率取自然对数使上升倍数或下降倍数有相同的权重；

(iii)基因表达量上升者确认有癌症的存在风险，基因表达量下降者不予考虑；以及

(iv)加总个体基因表达上升者所属权重即为患者的癌症风险指数；

该个别基因的基础表达量是取自非癌症控制组的含核酸的体液的检体样本的相对应癌症基因的表达量的几何平均数；

以步骤(c)计算非癌症控制组的癌症风险指数；

其中基于该患者的癌症风险指数低于该非癌症控制组的癌症风险指数的中位数者，是代表该患者具有癌症复发的低风险；基于该患者的癌症风险指数高于该非癌症控制组的癌症风险指数99％可信区间者，代表该患者具有癌症复发的高风险。

6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，所述步骤(b)是经由微数组芯片、实时聚合酶链锁反应、Northern印记杂交法或原位杂交量测。

7.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，所述癌症为乳癌、胃癌、膀胱癌或肝癌。

8.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，所述检体样本为外周血单核细胞样本。