[发明专利]一种胰腺癌易感基因检测分型试剂盒及其应用

说明书

技术领域

本发明涉及一种检验技术领域，具体是一种胰腺癌易感基因检测分型试剂盒及其应用。

背景技术

随着人类基因组计划(Human Genome Project，HGP)的完成，大量疾病相关基因的发现，促进了传统生物医学模式向可预测性、可预防性、个体化和参与性的基因组医学模式转变，为未来发展预防、诊断、治疗长期困扰人类的诸如癌症、心脑血管疾病、糖尿病、神经和精神疾病等重大复杂性疾病开辟了新途径，也为基因科学的产业化提供了良好的机遇。

全基因组关联分析(Genome Wide Association Studies，GWAS)是应用人类基因组中数以百万计的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，SNP)为标记进行病例一对照关联分析，即在一定人群中收集病例组和对照组DNA，进行SNPs芯片扫描，采用关联分析比较受检SNPs标记的某一等位基因频率在病例组和对照组间有无显著性差异，筛选与疾病关联的基因序列变异，做出该SNPs是否与疾病关联的判断，预测疾病的患病率及风险。该方法研究前不需构建任何假设，不再局限于候选基因或候选染色体区域作为关联分析对象，而是针对基因组中所有SNPs，随机进行基因分型，分析SNPs与疾病的关联度，可在全基因组水平上，开展多中心、大样本、反复验证的基因与疾病的关联研究，全面及时疾病发生、发展和治疗的相关遗传基因。

目前发现遗传因素，或其与环境因素之间的相互作用参与了几乎所有的人类疾病的发生过程。一些复杂的疾病往往不是由单一基因突变引起的，其发生发展与多基因多位点变异有关，且这些位点的变异可能与环境因素相关，这些位点可提高或降低个体患某种疾病的相对风险，被称为该种疾病的易感位点。根据大量的GWAS结果，已经发现并证明的一系列复杂疾病的易感位点已被普遍应用于基因检测领域。

胰腺癌是一种恶性度极高的消化系统肿瘤，其早期症状隐匿，发现时多已是晚期，手术切除率低，预后差。随着人类生活习惯与饮食结构的改变，胰腺癌的发病率在全球范围内逐年上升。胰腺癌发病是遗传因素和环境因素相互作用的结果，其可能与基因突变、基因多态性、表观遗传等因素引起的遗传易感性提高有关。某些与胰腺癌相关的危险因素诸如吸烟、肥胖、饮酒、慢性胰腺炎、糖尿病等已越来越受到广泛关注。近年来胰腺癌的发病率在全球范围内呈逐年上升趋势，2010年全世界新发胰腺癌病例预计已达到293 541例(Jacques Ferlay,Shin H R,Bray F,et al.Estimates of worldwide burden of cancer in 2008:GLOBOCAN2008[J].International Journal of Cancer Journal International Du Cancer,2010,127(12):2893-917.)。

三叶因子家族(Trefoil Family Factor,TFF)均含有一个类似结构域，由六个半胱氨酸残基通过二硫键折叠成三叶草性状。TFF2是第一个被发现的三叶因子家族成员，在猪胰岛纯化胰岛素过程被发现。TFF1最初在雌激素诱导乳腺癌细胞中发现，又被命名为人乳腺癌相关肽2(hpS2)，TFF1三叶肽结构域含有42个氨基酸残基(Thr6to Pro47)，TFF1通过Cys58形成分子间二硫键形成同源二聚体或与其他蛋白共同形成25KD的复合物。基因芯片分析表明，在人体内胰腺癌细胞TFF1表达量远远高于正常胰腺细胞(Arumugam T,Hwang R,Todd M,et al.TFF1is over expressed early in pancreatic cancer in response to cancer-stromal interactions and stimulates cancer cell invasiveness.[J].Cancer Research,2007,67.)。