[发明专利]一种X染色体高密度探针定制的全基因组拷贝数检测芯片有效
申请号: | 201610685090.1 | 申请日: | 2016-08-18 |
公开(公告)号: | CN106282349B | 公开(公告)日: | 2019-12-03 |
发明(设计)人: | 陈晓丽 | 申请(专利权)人: | 陈晓丽 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883 |
代理公司: | 11594 北京知联天下知识产权代理事务所(普通合伙) | 代理人: | 王冲<国际申请>=<国际公布>=<进入国 |
地址: | 100020*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 发育障碍 高密度探针 拷贝数检测 基因芯片 基因诊断 可靠信息 密度检测 全基因组 遗传病因 遗传咨询 灵敏度 男童 预后 患儿 筛查 芯片 诊断 基因 | ||
1.一种全基因组拷贝数检测芯片,其中所述芯片包含的检测X染色体的探针数量为21346个,包含的检测X染色体上的90个重要疾病相关基因的探针数量为18837个,包含的检测X染色体上的90个重要疾病相关基因的1502个外显子的探针数量为9712个;其中90个基因的探针为:ABCD1、ACSL4、AFF2、AP1S2、ARHGEF9、ARX、ATP7A、ATRX、AVPR2、BCOR、BRWD3、CASK、CDKL5、CUL4B、DCX、DKC1、DLG3、DMD、EIF2S3、FANCB、FGD1、FLNA、FMR1、FTSJ1、GDI1、GK、GPC3、GRIA3、HCCS、HDAC6、HDAC8、HPRT1、HSD17B10、HUWE1、IDS、IGBP1、IKBKG、IL1RAPL1、KDM5C、KIAA2022、L1CAM、LAMP2、LAS1L、MAOA、MBTPS2、MECP2、MED12、MID1、MTM1、NAA10、NDP、NDUFA1、NHS、NLGN3、NLGN4X、NSDHL、OCRL、OFD1、OPHN1、OTC、PAK3、PCDH19、PDHA1、PGK1、PHF6、PHF8、PLP1、PORCN、PQBP1、PRPS1、RAB39B、RAB40AL、RBM10、RPL10、RPS6KA3、SHROOM4、SLC16A2、SLC6A8、SLC9A6、SMC1A、SMS、SOX3、SYN1、SYP、TIMM8A、TSPAN7、UBE2A、UPF3B、ZDHHC9和ZNF711;其中检测90个重要疾病相关基因的1502个外显子的9712个探针的设计区域以及各区域探针数目为:
该检测1502个外显子的9712个探针中,大于98%的外显子有至少2个探针,大于88%的外显子有至少3个探针,大于69%的外显子有至少4个探针,大于44%的外显子有至少5个探针。
2.根据权利要求1所述的芯片,其用于检测精神发育障碍患者的拷贝数变异。
3.根据权利要求2所述的芯片,其还包含固相载体,所述固相载体选自玻片、金属片、硅片、陶瓷片、塑料片、硝酸纤维膜、尼龙膜中的一种或多种。
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