[发明专利]一种鼻咽癌辅助诊断或者疗效预测用的生物标记物及其应用

说明书

本发明公开了一种鼻咽癌辅助诊断或者疗效预测用的生物标记物及其应用，主要是用于制备鼻咽癌辅助诊断或者疗效预测的实时荧光定量检测试剂。实时荧光定量PCR技术验证了长链非编码RNA LINC01420在鼻咽癌和慢性炎症鼻咽上皮组织中的表达情况，LINC01420在鼻咽癌组织中表达显著上调。本发明为鼻咽癌的早期发现、早期治疗提供了重要的参考依据。

技术领域

本发明属于肿瘤分子生物学领域，具体涉及一种鼻咽癌辅助诊断或者疗效预测用的生物标记物长链非编码RNA LINC01420，以及检测该RNA表达量的试剂用于制备鼻咽癌辅助诊断或者疗效预测制剂的用途。

背景技术

人类基因组计划及其后续的DNA元件百科全书计划(The Encyclopedia of DNAElements Project,ENCODE)研究成果表明，蛋白编码基因序列仅占人类基因组序列的1-3％，而人基因组中绝大部分可转录的序列为长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)。LncRNA广泛地存在于各种生物中，且随着生物复杂程度的升高，基因组中lncRNA序列的比例也相应地增大，提示lncRNA在生物进化过程中有重要意义。随着lncRNA不断被发现，它们的功能逐渐被诠释，科学家们发现lncRNA广泛而活跃地参与到生命活动不同层面的功能调控中，作为一个崭新的领域，已经成为国际生命科学研究领域新的前沿与热点。

LncRNA可作为功能蛋白质的信号(signal)、诱导(guide)、诱饵(decoy)或支架(scaffold)分子等多种方式，在染色质重构、基因转录、翻译及蛋白修饰等多重水平调控基因的表达，并在包括发育、免疫、生殖等基本生理过程中扮演了不可替代的角色，更重要的是，lncRNA的表达与功能失调已经与包括恶性肿瘤在内的人类多种疾病紧密联系在了一起。因此，深入研究lncRNA的功能，揭示由lncRNA介导的遗传信息传递方式和表达调控网络，不仅可以从蛋白编码基因以外的角度重新注释和阐明基因组的结构与功能，深入发现生命活动的本质和规律，还有望从一个新的视角认识包括肿瘤在内的多种人类常见疾病的发病机理，并为这些疾病的诊断与治疗提供新的分子标志物与治疗靶点。

鼻咽癌是常见高发的头颈部恶性肿瘤，容易发生颈部淋巴结转移，预后较差。研究表明，这种肿瘤的发生发展是多基因参与、多步骤、多阶段的复杂过程，LncRNA在鼻咽癌的发生发展过程中可能也起到了重要的作用。最近我们发现lncRNA LINC01420(NCBIaccession number:NR_015367)在鼻咽癌组织中表达上调，针对该lncRNA的检测制剂也可以用于鼻咽癌的辅助诊断。我们进一步增加样本，在110例有临床随访资料的鼻咽癌石蜡存档标本中，通过原位杂交(in situ hybridization)的方法检测了LINC01420的表达水平，发现LINC01420在鼻咽癌组织中表达上调，高表达LINC01420的鼻咽癌患者比低表达LINC01420的鼻咽癌患者预后差，因此针对该lncRNA的检测制剂也可以用于鼻咽癌的预后判断。

我们通过设计并合成靶向LINC01420siRNA序列，转染到鼻咽癌细胞株中，在体外培养系统证实靶向干扰LINC01420的表达可明显抑制鼻咽癌细胞的侵袭与转移能力。

发明内容

针对上述现有技术，本发明的目的是提供一种鼻咽癌辅助诊断或者疗效预测用的生物标记物长链非编码RNA LINC01420，以及检测鼻咽癌组织中该RNA表达量的试剂用于制备鼻咽癌辅助诊断或者疗效预测制剂的用途。

一种鼻咽癌辅助诊断或者疗效预测用的生物标记物为长链非编码RNALINC01420，该长链非编码RNA LINC01420的序列如SEQ NO:1所示。

检测鼻咽癌组织中长链非编码RNA LINC01420表达量的试剂的应用，所述的试剂用于制备鼻咽癌辅助诊断或者疗效预测制剂；该长链非编码RNA LINC01420的序列如SEQNO:1所示。