[发明专利]一种经济快速提取酒醅中微生物基因组DNA的方法有效
申请号: | 201610806782.7 | 申请日: | 2016-09-07 |
公开(公告)号: | CN106399297B | 公开(公告)日: | 2020-02-14 |
发明(设计)人: | 晏培;胡传旺;卢建军;杨帆;方芳;王莉;陈坚 | 申请(专利权)人: | 贵州茅台酒股份有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 11111 北京市万慧达律师事务所 | 代理人: | 谢敏楠;梁顺珍 |
地址: | 564501*** | 国省代码: | 贵州;52 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 酒醅 微生物基因组DNA 分子生物学分析 微生物基因组 荧光定量PCR 核酸纯化柱 微生物细胞 白酒酿造 粗提取液 核酸纯化 去离子水 乙醇洗脱 硅胶膜 结合液 裂解液 石英砂 异戊醇 苯酚 测序 称取 核酸 可用 氯仿 破壁 过滤 震荡 蛋白 保存 节约 | ||
1.一种经济快速提取酒醅中微生物基因组DNA的方法,包括以下步骤:
1)酒醅中微生物细胞破壁:将研磨剂、酒醅样品和裂解液混和后高速震荡,然后离心;所述的研磨剂为石英砂;所述的石英砂粒径为12-20目;所述裂解液配方如下:1.5-2.5%CTAB (w/v),90-112 mM pH 8.0的Tris-HCl,18-24mM pH8.0的EDTA,1.2-1.6 M NaCl;所述研磨剂、酒醅样品和裂解液三者的比例依次为15~22g:6~9g:16~24mL;
2)核酸纯化:
a)除杂:取步骤1)中离心后的上清液加入P.C.I混匀,离心;所述的P.C.I为24-26体积苯酚:23-25体积氯仿:0.5-1.5体积异戊醇;所述P.C.I与上清液的体积比为0.8~1.2:1;
b)过柱:将离心后的上清液与硅胶膜结合液混匀,然后过核酸纯化柱,离心弃滤液;所述的硅胶膜结合液为pH为4-6.5的盐酸胍与乙酸钾的混合液;所述上清液与硅胶膜结合液的体积比为1:1.5~2.5;所述盐酸胍与乙酸钾的摩尔质量比为:3-4M:0.5M;
c)洗柱:加入70%乙醇过核酸纯化柱,然后高速离心甩干核酸纯化柱,自然条件下干燥;
d)洗脱:在核酸纯化柱的硅胶膜上加洗脱液溶解DNA,离心洗脱下DNA溶液;所述洗脱液选自无菌水或TE溶液。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于所述的石英砂粒径为16目。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤1)中,研磨剂、酒醅样品和裂解液三者的比例依次为18.5g:7.5g:20mL。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤1)中,裂解液配方为:2% CTAB (w/v),100 mM pH 8.0的Tris-HCl,20 mM pH 8.0的EDTA,1.4 M NaCl。
5.如权利要求1所述的方法,其特征在于步骤a)中,所述的P.C.I为25体积苯酚:24体积氯仿:1体积异戊醇,P.C.I与上清液的体积比为0.8~1.2:1。
6.如权利要求1所述的方法,其特征在于步骤b)中,
硅胶膜结合液为pH为5的盐酸胍与乙酸钾的混合液。
7.如权利要求1所述的方法,其特征在于步骤b)中,
盐酸胍与乙酸钾的摩尔质量比为:4M:0.5M。
8.如权利要求 1所述的方法,其特征在于,包括以下步骤:
将12~20目的石英砂灭菌烘干后,称取15~22g装入50mL无菌离心管中;
称取6~9g酒醅样品于离心管,加入16~24mL裂解液,均质仪震荡1min,10000rpm离心10min;
转移上清至50mL无菌离心管中,加0.8~1.2mL的P.C.I,摇匀,11000rpm离心20min;所述的P.C.I为25体积苯酚:24体积氯仿:1体积异戊醇;
转移上清至50mL无菌离心管中,加1.5~2.5mL的硅胶膜结合液,摇匀;用15mL核酸纯化柱过滤,弃滤液,滤完为止;
吸附柱中加2.5~3.5mL 70%乙醇,过滤,弃滤液,重复一次;
10000rpm空管离心2min,弃滤液;
纯化柱自然条件下干燥30~60min,加入50~300μL无菌去离子水或TE溶液溶解DNA,过滤,滤液装于1.5mL无菌离心管中,-20℃保存备用。
9.如权利要求8所述的方法,其特征在于,所述的裂解液配方为2% CTAB (w/v),100 mMpH 8.0的Tris-HCl,20 mM pH8.0的EDTA,1.4 M NaCl。
10.如权利要求8所述的方法,其特征在于,所述的硅胶膜结合液pH为5;所述的硅胶膜结合液为4M盐酸胍:0.5M乙酸钾。
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