[发明专利]一种Lewis血型抗原检测方法在审
申请号: | 201611006874.3 | 申请日: | 2016-11-16 |
公开(公告)号: | CN107630080A | 公开(公告)日: | 2018-01-26 |
发明(设计)人: | 虞先濬;罗国培;刘辰;郭萌;金凯舟 | 申请(专利权)人: | 复旦大学附属肿瘤医院 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869 |
代理公司: | 上海元一成知识产权代理事务所(普通合伙)31268 | 代理人: | 吴桂琴 |
地址: | 200032 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 lewis 血型 抗原 检测 方法 | ||
1.一种Lewis血型抗原检测方法,其特征在于,其包括步骤:
1)设计检测Lewis血型抗原的多重PCR反应引物,以及设定特定的PCR反应条件,将所有位点通过一个PCR反应完成;
2)通过第一代测序方法检测Lewis相关基因FUT2和FUT3的基因型,并通过基因型确定Lewis抗原表型。
2.按权利要求1所述的方法,其特征在于,所述多重PCR反应的引物序列如下式所示:
3.按权利要求1所述的方法,其特征在于,使用DNA提取试剂盒提取基因组DNA;使用微型离心机或真空处理从全血或淋巴细胞中提取总基因组DNA。
4.按权利要求1所述的方法,其特征在于,PCR扩增的位点包括FUT3:59,202,314位点(358F/R),508,1067位点(P1F/P1R),以及FUT2:357,385,428,571,739位点(FUT2 1F/2R);
PCR反应条件为:1:94℃5min;2:94℃30s;3:Tm 62℃30s;4:72℃30s(To step2 38 cycles);5:72℃10min。
5.按权利要求1所述的方法,其特征在于,PCR反应产物进行琼脂糖凝胶电泳:控制电压在110V,电流在40mA以上;用DNA marker标记产物大小。
6.按权利要求5所述的方法,其特征在于,获得的片段分离后,在紫外灯下切取所需条带,DNA在紫外灯下爆光时间不超过30s。
7.按权利要求5所述的方法,其特征在于,将胶回收产物加入测序仪,通过一代测序Sanger测序法检测序列。
8.按权利要求7所述的方法,其特征在于,对过的的测序图进行基因型分析,采用Chromas软件打开测序图,分析各个位点的情况;将获得基因型整合分析。
9.按权利要求1或8所述的方法,其特征在于,通过基因型确定表型;其中,
FUT3阴性的基因型包括纯合突变:T202C或C314T或G508A或T1067A;杂合突变:T59G/G508A合并T202C/C314T;T59G/T1067A合并T202C/C314T,T59G合并T202C/C314T,T59G/G508A/T1067A合并T202C/C314T;以及T59G纯合突变合并杂合:T202C或C314T或G508A或T1067A;
FUT2阴性包括除FUT3阴性的所有的FUT2纯合突变;
FUT2阳性,FUT3阳性:Le(a-b+)表型;FUT2阴性,FUT3阳性:Le(a+b-)表型;FUT2杂合,FUT3阳性:Le(a+b+)表型;FUT3阴性Le(a-b-)表型。
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