[发明专利]黄瓜炭疽病菌LAMP检测引物及其应用有效
申请号: | 201611081522.4 | 申请日: | 2016-11-30 |
公开(公告)号: | CN106755339B | 公开(公告)日: | 2019-11-19 |
发明(设计)人: | 兰成忠;吴玮;阮宏椿;姚锦爱 | 申请(专利权)人: | 福建省农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6844;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 35100 福州元创专利商标代理有限公司 | 代理人: | 蔡学俊<国际申请>=<国际公布>=<进入 |
地址: | 350013 福建省福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 黄瓜炭疽病菌 引物组合物 条带 环介导等温扩增 黄瓜炭疽病 黄瓜炭疽菌 特异性引物 待测样品 分子检测 结果检测 绿色荧光 显色结果 电泳 样品DNA 橘黄色 橙色 检测 显色 阴性 引物 灵敏 防治 观察 应用 | ||
1.黄瓜炭疽病菌LAMP检测引物,其特征在于,其核苷酸序列为:
F3: 5’- GGGGCTAACTGCTTGAACAG -3’,
B3: 5’- GGTGCCGTTGTACCTGTT -3’,
FIP: 5’- TGTGCGAAGCATCGTTGCCGGGTAACCAGATTGGTGCTGC -3’,
BIP: 5’- AGGCAAAACATCTCTGGCGAGCCCATTCTTGACGTGGCCTTA - 3’。
2.一种利用权利要求1所述引物进行黄瓜炭疽病菌LAMP检测的方法,其特征在于,包括以下具体步骤:
(1)提取待测样品基因组DNA;
(2)LAMP反应体系的建立:LAMP检测反应体系为25 μL,以步骤(1)提取的DNA为模板,反应体系包括5 μM F3和B3各1.0 μL,40 μM FIP和BIP各1.0 μL,LAMP反应混合液12.5μL,8 U
(3)LAMP反应条件:63.5 ℃温育60 min,85℃灭活5min;
(4)反应结果的测定:采用荧光染料目测观察法或琼脂糖凝胶电泳法进行测定:
采用荧光染料目测观察法,待LAMP反应结束后,在LAMP反应的扩增产物中加入显色剂SYBR green Ⅰ 1.0 μL,显色结果观察到绿色荧光的判断为阳性,橙色或橘黄色判断为阴性;
采用琼脂糖凝胶电泳法,取2.0 μL LAMP扩增产物用2%琼脂糖凝胶电泳检测,如出现梯形条带判断为阳性,没有出现条带则判断为阴性。
3.如权利要求2所述的一种黄瓜炭疽病菌LAMP检测方法,其特征在于,所述的LAMP反应混合液由以下组分组成:40 mM Tris-HCl,20 mM (NH4)2SO4,20 mM KCl,16 mM MgSO4,1.6mol/L甜菜碱,2.0 mM dNTPs,0.2% Trion X-100。
4.利用权利要求1所述的黄瓜炭疽病菌LAMP检测引物在黄瓜炭疽病菌的早期诊断和病菌的监测、鉴定上的应用。
5.利用权利要求2所述的黄瓜炭疽病菌LAMP检测方法在黄瓜炭疽病菌的早期诊断和病菌的监测、鉴定上的应用。
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