[发明专利]用于检测番茄晚疫病菌的LAMP引物组合物和应用有效
申请号: | 201611109562.5 | 申请日: | 2016-12-06 |
公开(公告)号: | CN106636378B | 公开(公告)日: | 2020-07-17 |
发明(设计)人: | 兰成忠;姚锦爱;阮宏椿;吴玮 | 申请(专利权)人: | 福建省农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 福州元创专利商标代理有限公司 35100 | 代理人: | 蔡学俊;陈彩芳 |
地址: | 350013 福建省福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 番茄 晚疫病 lamp 引物 组合 应用 | ||
1. 用于检测番茄晚疫病菌的LAMP引物组合物,其特征在于,所述引物组合物由4条特异性引物组成,包括1对外侧引物F3/B3和1对内侧引物FIP/BIP,F3/B3和FIP/BIP引物序列如下:F3: 5’-GCCGATGAGGTCATGTGC-3’,B3: 5’-GTTCACGGCCAGCTTACG-3’,FIP: 5’-AGTGGGGGTGGTGAGCTTCACTG- GACAATGAGGCCCTGTA-3’,BIP: 5’-GGTGACCTGAACCACTTGGTGTGTTC- AGCTGACCGGGGAA- 3’。
2.一种番茄晚疫病菌LAMP检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取待测样品基因组DNA;
(2)LAMP反应体系的建立:以步骤(1)提取的DNA为模板,利用权利要求1所述的外侧引物F3/B3和内侧引物FIP/BIP进行LAMP扩增,LAMP检测反应体系为25 μL,包括5 μM外侧引物F3和B3各1.0 μL,40 μM内侧引物FIP和BIP各1.0 μL,LAMP反应混合液12.5μL,8 U
(3)LAMP反应条件:64 ℃温育60 min;
(4)反应结果的测定:采用荧光染料目测观察法进行测定,待LAMP反应结束后,在LAMP反应的扩增产物中加入显色剂SYBR greenⅠ1.0 μL,显色结果观察到绿色荧光的判断为阳性,存在番茄晚疫病菌,橙色或橘黄色判断为阴性,不存在番茄晚疫病菌。
3. 根据权利要求2所述的一种番茄晚疫病菌LAMP检测方法,其特征在于,步骤(2)所述的LAMP反应混合液由以下组分组成:40 mM Tris-HCl,20 mM (NH4)2SO4,20 mM KCl,16 mMMgSO4,1.6 mol/L甜菜碱,2.0 mM dNTPs,0.2wt.% Trion X-100。
4.如权利要求1所述的引物组合物在番茄晚疫病的早期诊断和病菌的监测、鉴定上的应用。
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