[发明专利]KIAA1462基因启动子区变异位点及其在提高鹅产蛋性能上的应用有效

专利信息
申请号: 201611113063.3 申请日: 2016-12-07
公开(公告)号: CN108165635B 公开(公告)日: 2021-07-13
发明(设计)人: 陈杰;夏梦圆;喻世刚;韦伟;刘红林 申请(专利权)人: 南京农业大学
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12N15/11
代理公司: 南京天华专利代理有限责任公司 32218 代理人: 徐冬涛
地址: 211225 江苏省南京市溧*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: kiaa1462 基因 启动 子区 变异 及其 提高 鹅产蛋 性能 应用
【说明书】:

发明属于分子生物学领域,提供一种KIAA1462基因启动子区变异位点及其在扬州鹅产蛋性状选育上的应用。该突变位点位于KIAA1462基因启动子区转录起始位点上游696bp处,具有多态性SNP位点,分别为鸟嘌呤G或胞嘧啶C,从而获得了与扬州鹅产蛋性状相关的功能基因及分子遗传标记,为鹅产蛋性状的选育工作提供了理论依据。

技术领域

本发明属于分子生物学领域,涉及KIAA1462基因启动子区变异位点及其在提高鹅产蛋性能上的应用。

背景技术

KIAA1462是一个未知基因,它是通过简化基因组测序技术(RAD-sequencing)筛选产蛋性能候选SNP,发现的一个与鹅产蛋性能相关的功能基因。在人类研究中,KIAA1462在女性减数分裂基因重组过程中扮演着重要的角色,在减数分裂过程中的突变会导致流产的发生。KIAA1462基因在小鼠第一次减数分裂卵母细胞中以及新生小鼠卵巢中表达量非常高。还有研究表明KIAA1462作为冠状动脉疾病相关的基因产物,是血管内皮细胞连接的重要组分。

鹅的产蛋机理复杂,受激素、环境等多种因素的影响,还与其繁殖性能密切相关。产蛋性能作为种鹅选育的一大标准,基础研究薄弱,对于鹅产蛋性状的选育工作困难重重,严重制约着养鹅业朝着科学性规模化发展。

发明内容

发明人通过创造性发现了一个与鹅产蛋性能相关的突变位点,为鹅产蛋性状选育提供了理论依据。

本发明的目的通过以下技术方案实现:

本发明提供的技术方案之一:提供KIAA1462基因启动子区变异位点,该突变位点位于KIAA1462基因启动子区转录起始位点上游696bp处,具有多态性SNP位点,分别为鸟嘌呤G或胞嘧啶C,所述KIAA1462基因序列信息为NCBI网站上的公开的鹅参考基因组(NM_013185782.1)序列信息,Gene ID:106042667。

所述SNP位点与鹅产蛋性能相关,是一个新的分子标记。

本发明提供的技术方案之二:所述SNP突变位点在家禽遗传育种中的应用,所述应用优选为根据SNP位点的基因型对鹅产蛋性能进行早期选择。

其中,所述早期选择的分型判断依据为:GG基因型鹅产蛋性能优于GC基因型和CC基因型个体,GC基因型鹅产蛋性能优于CC基因型个体。所述GG基因型鹅是指SNP位点为G的纯合子鹅,为高产基因型;所述CC基因型鹅是指SNP位点为C的纯合子鹅,为低产基因型;所述GC基因型鹅是指SNP位点为G和C的杂合子鹅。

所述KIAA1462基因启动子区突变位点作为选育鹅的一个分子标记的应用,方法为:检测鹅KIAA1462基因启动子区转录起始位点上游696bp处的脱氧核苷酸,以“GG基因型鹅产蛋性能优于GC基因型和CC基因型个体,GC基因型鹅产蛋性能优于CC基因型个体”进行选育。

进一步的,所述KIAA1462基因启动子区突变位点作为选育鹅的一个分子标记的应用,具体方法如下:

1)提取鹅血液DNA;

2)通过AS-PCR方法以引物KIAA1462-S1、KIAA1462-S2、KIAA1462-AS对DNA进行扩增及琼脂糖电泳检测;

所述引物的核苷酸序列为:

KIAA1462-S1序列如:TCCCAGAATACAGAGCACTCC(如SEQ ID NO.1所示),

KIAA1462-S2序列如:TCCCAGAATACAGAGCACTCG(如SEQ ID NO.2所示);

KIAA1462-AS序列如:CCACCCTTACAATAAAGCACATC(如SEQ ID NO.3所示)。

3)根据分型判断依据,确定高产基因型的公鹅和母鹅并进行配种。

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