[发明专利]一种基于互作网络正负关系比值的分类技术及其用途

权利要求书

1.一种基于互作网络中正负关系比值用于区分疾病相关菌群的分类装置，其特征在于，所述的互作网络正负关系比值的计算公式如下，

其中，P/N为互作网络中正负关系比值，p为互作网络中正相互作用关系的数量，n为互作网络中负相互作用关系的数量；

所述的分类装置，针对HIV感染相关肠道菌群、与吸烟相关的口腔菌群、特应性皮炎相关的皮肤菌群、细菌性阴道病相关的阴道菌群，肺纤维化相关的呼吸道内菌群，还包括如下步骤：

1)给定已知正常菌群样本，以及待测可能与疾病相关的菌群样本，基于16SrDNA标准DNA提取、扩增、测序及生物信息分析流程，获得每个样本菌群的细菌物种组成，及每个物种对应的测序读段数目；

2)通过生物信息学分析得到以97％相似性为基准聚类的OTU表，其中每个OTU代表一个物种，每一个样本中该OTU的测序内容代表该OTU在该样本内的物种丰度；

3)基于菌群细菌物种组成及物种丰度，计算各菌群内细菌物种间的相互作用关系，并构建正常菌群和待测菌群的互作网络；

4)统计各菌群互作网络中正相互作用关系的数量和负相互作用关系的数量，通过计算获得各网络的P/N比值；

5)以给定正常菌群互作网络的P/N比值作为基准，根据待测菌群互作网络的P/N比值对待测菌群进行分类判定。

2.根据权利要求1所述的一种基于互作网络中正负关系比值用于区分疾病相关菌群的分类装置，其特征在于：所述装置以任何软件和硬件形式实现其算法和功能。