[发明专利]用于诊断肺腺癌的长链非编码RNA标志物

说明书

本发明提供一种长链非编码RNA及其应用。本发明的研究表明LOC102724660在肺腺癌组织中和在癌旁组织中的表达存在显著差异，据此认为LOC102724660可以作为诊断肺腺癌的分子标志物。根据LOC102724660在肺腺癌组织中呈现低水平表达，在肺腺癌细胞中过表达LOC102724 660，研究LOC102724660在肺腺癌中的作用，结果表明过表达LOC102724660能够明显抑制肺腺癌细胞的增殖。本发明揭示了LOC102724660在肺腺癌发病机制中的重要作用，也为肺腺癌的临床诊断、治疗和预后监测提供了新的分子标记和药物靶点。

技术领域

本发明属于生物医学领域，涉及用于诊断肺腺癌的长链非编码RNA标志物。

背景技术

人体中编码蛋白质的基因大约有2-3万个，仅占人类基因组的2％，其余98％不编码蛋白质的基因组DNA最初被认为是没有功能的，是生物体中的垃圾，通常被称为“垃圾DNA”。

但目前的研究表明，这些垃圾DNA大多可转录产生非编码RNA(non-codingRNA，ncRNA)。根据成熟转录本大小的不同，ncRNA可分为小分子ncRNA(如siRNA，miRNA，piRNA等)，中等长度ncRNA(70-200nt)和长ncRNA(long ncRNA，LncRNA，>200nt)。

目前，ncRNA领域研究较多的是小分子ncRNA，而对LncRNA的研究还处于起步阶段。由于序列内部存在过多的终止密码子，LncRNA不能被翻译成蛋白质，他们通常是以RNA转录本的形式行使其生物学功能，如发育过程中的细胞分化、细胞增殖、细胞凋亡和类固醇代谢等。

最近的研究发现LncRNA与肺癌、非霍杰金淋巴瘤、皮肤T细胞淋巴瘤和慢性淋巴细胞白血病等肿瘤疾病有关。这表明LncRNA与细胞的癌变有着极为密切的联系，LncRNA在细胞增殖、分化和癌变中发挥着重要的作用。

目前，已经克隆的人类lncRNAs基因已超过4万多个，但绝大部分lncRNA的功能未知。

发明内容

本发明的目的在于提供一种用于诊断肺腺癌的长链非编码RNA标志物。本发明利用高通量测序和QPCR实验证明LOC102724660在肺腺癌组织中的表达水平明显低于在癌旁组织中的水平，因此可以将LOC102724660作为诊断肺腺癌的分子标志物。

为了实验上述目的，本发明采用了如下技术方案：

本发明提供了检测长链非编码RNA表达的试剂在制备肺腺癌辅助诊断或预后预测产品中的应用；所述长链非编码RNA的编码基因Gene ID：102724660。

本发明的长链非编码RNA在NCBI中的命名为LOC102724660。属于基因ID：102724660编码产物的LOC102724660具有不同长度的转录本，因此本发明的长链非编码RNA-LOC102724660可以是Genbank登录号XR_927947(具有681bp的长度，相应的DNA序列如SEQ ID NO.1所示)、Genbank登录号XR_927946(具有2459p的长度，相应的DNA序列如SEQ IDNO.4所示)、Genbank登录号XR_428245(具有2305p的长度，相应的DNA序列如SEQ ID NO.5所示)、Genbank登录号XR_927948(具有688p的长度，相应的DNA序列如SEQ ID NO.6所示)、Genbank登录号XR_428246(具有686p的长度，相应的DNA序列如SEQ ID NO.7所示)中的任意一个或者多个。

进一步，所述试剂包括利用SYBR Green、TaqMan探针、分子信标、双杂交探针、或复合探针检测LOC102724660表达量时使用的PCR扩增引物。

在本发明的具体实施方案中，所述引物序列如SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示。