[发明专利]用于鉴定瘿椒树性别的基因序列及其应用

说明书

本发明提供一种用于鉴定瘿椒树性别的基因序列，该基因序列用于鉴定瘿椒树的雄性及两性性别，利用该基因序列获取的SCAR分子标记引物，可快速简单判断瘿椒树雄性及两性性别。本发明提供的鉴定瘿椒树性别的SCAR标记引物，包括正向引物TS‑SCAR‑F和反向引物TS‑SCAR‑R，具体序列为：TS‑SCAR‑F：5＇‑ATCTTCATAGCCGCATAGCAAA‑3＇，TS‑SCAR‑R：5＇‑CCAAATCCTTCAACAATATACCTG‑3＇。本发明将获得的雄性特异性的SRAP分子标记成功转化为可以100％对瘿椒树不同性别进行鉴定的稳定，准确，简单的SCAR标记。应用本发明所提供的SCAR引物组合可以对人工栽培及不同地区野生居群瘿椒树性别进行准确鉴定，应用范围广泛。

技术领域

本发明属于分子生物学DNA分子标记检测技术领域，具体涉及到利用SCAR快速鉴定瘿椒树性别的方法。

背景技术

瘿椒树(Tapiscia sinensis Oliver.),也称银鹊树，为雄全异株繁育系统，雄全异株(Androdioecy)繁育系统是被子植物中最为罕见的一类，所以其又是研究被子植物繁育系统演化及植物进化生活史方面的重要材料。确定瘿椒树早期的性别有助于研究雄全异株植物性别决定的遗传原理，有助于理解植物繁育系统的进化与维持。另外，不同性别的瘿椒树具有不同的经济价值，因此在实际应用中，根据目的的不同可选择合适的性别比例进行栽培。

SRAP(Sequence Related Amplified Polymorphism，相关序列扩增多态性)标记是美国加州大学Li与Quiros于2001年在芸薹属植物中开发出来，一种基于PCR的新型分子标记技术。该标记具有简便、稳定、产率高、便于克隆目标片段等特点。SRAP分子标记电泳结果分辨率高，稳定性好，易于测序，被广泛使用在遗传多样性分析等分子生物学领域，但SRAP分子标记应用于植物性别鉴别研究很少。SCAR(Sequence Charactered AmplifiedRegion，序列特征化扩增区域)标记是1993年在RAPD等分子标记技术的基础上发展起来的。在获得一个与目标性状连锁的SRAP特异扩增 条带后，进行条带回收测序，重新设计一对特异性的引物，并利用此特异性引物进行基因组PCR，从而将SRAP标记转化为更加直观的通过“有和无”条带判别的稳定，简便，重复性好的固定标记SCAR标记。获得与瘿椒树性别决定基因紧密连锁的SCAR分子标记，目前未见有报道。

发明内容

鉴于现有技术存在的问题，本发明的目的在于提供一种利用SCAR分子标记快速进行瘿椒树性别鉴定的方法，从而解决现有技术中无法准确快速进行瘿椒树早期性别鉴定的问题。

为解决上述问题，本发明采用以下技术方案来实现：

一种用于鉴定瘿椒树性别的基因序列：

ATTTCGCTAGGGTTTATAGCTTCTTACATCCTCTTCAGTCTTCTCAGTACCTCCCTTCCTATATAATCTTCATAGCCGCATAGCAAACCCTGGCTAGGGCTTCTTCTAATTTTCTCCGGTACTTTCTCTGTACTTTTCTCTGCATCTACCACTTTCAATATGATTTCTCTTTCCATTTTTTCATTTTGATCTGTTGATTTCAATTTTTTAGCTATGCATTTCTCTGTTTGTTTCGCGGGAAAACACTGAAAGTGAAAAAGAAAGAAAATTTTGGATCTCGAACTGATTCTGAGTGCCGATAGTATAAGACATTCCTTGTTTTAGTTATCCTTTTTATAGTAAATGTTCTAACTTTCAGTGATTGGTTTTTTTGATTTAGATCAGGTATATTGTTGAAGGATTTGGGTGTTATTGAATGTGTGTTTTGATGTATTG

所述基因序列用于鉴定瘿椒树的雄性及两性性别。

一种利用所述基因序列获取的SCAR标记引物，包括正向引物TS-SCAR-F和反向引物TS-SCAR-R，具体序列为：