[发明专利]一种用于构建枸杞DNA指纹图谱的引物组合以及应用和方法有效
申请号: | 201611169209.6 | 申请日: | 2016-12-16 |
公开(公告)号: | CN106755396B | 公开(公告)日: | 2019-12-06 |
发明(设计)人: | 曹有龙;尹跃;赵建华;安巍 | 申请(专利权)人: | 宁夏农林科学院枸杞工程技术研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 11371 北京超凡志成知识产权代理事务所(普通合伙) | 代理人: | 钱学宇<国际申请>=<国际公布>=<进入 |
地址: | 750000 宁夏回族*** | 国省代码: | 宁夏;64 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 枸杞 构建 毛细管电泳技术 数据分析处理 电泳分辨率 基因测序 结果基础 理论支持 引物组合 应用研究 灵敏度 多态性 可用 筛选 应用 开发 | ||
1.一种用于构建枸杞DNA指纹图谱的引物组合,其特征在于,其包括第1-15引物对,所述第1-15引物对的碱基序列分别如SEQ ID NO.1-2、SEQ ID NO.3-4、SEQ ID NO.5-6、SEQID NO.7-8、SEQ ID NO.9-10、SEQ ID NO.11-12、SEQ ID NO.13-14、SEQ ID NO.15-16、SEQID NO.17-18、SEQ ID NO.19-20、SEQ ID NO.21-22、SEQ ID NO.23-24、SEQ ID NO.25-26、SEQ ID NO.27-28、SEQ ID NO.29-30所示。
2.根据权利要求1所述的用于构建枸杞DNA指纹图谱的引物组合,其特征在于,所述第1-15引物对中每个引物对的上游引物的5’端标记有荧光基团;
或者所述第1-15引物对中每个引物对的下游引物的5’端标记有所述荧光基团。
3.根据权利要求2所述的用于构建枸杞DNA指纹图谱的引物组合,其特征在于,所述荧光基团为选自FAM、TAMRA、HEX和ROX中的任意一种。
4.权利要求1-3中任一项所述的用于构建枸杞DNA指纹图谱的引物组合在构建枸杞DNA指纹图谱中的应用。
5.一种构建枸杞DNA指纹图谱的方法,其特征在于,其包括:用权利要求1-3中任一项所述的用于构建枸杞DNA指纹图谱的引物组合的第1-15引物对分别对多个枸杞种质的DNA进行PCR扩增,得到扩增产物;
将所述扩增产物分别进行电泳,得到扩增带型数;
将所述扩增带型数进行编码处理,得到每一种所述枸杞种质的DNA对应所述第1-15引物对的第1-15编号,串联所述第1-15编号形成字符串。
6.根据权利要求5所述的构建枸杞DNA指纹图谱的方法,其特征在于,所述编码处理是指:将所述第1-15引物对中每对引物对对应的所述扩增带型数按照升序排列,并按顺序标号,当序号数小于9时,用数字1-9顺序表示,当序号数大于9时,用英文字母A-Z顺序表示。
7.根据权利要求5所述的构建枸杞DNA指纹图谱的方法,其特征在于,串联所述第1-15编号形成所述字符串是指:按第3编号、第5编号、第7编号、第11编号、第13编号、第8编号、第10编号、第14编号、第1编号、第15编号、第12编号、第4编号、第2编号、第9编号、第6编号的顺序进行串联形成所述字符串。
8.根据权利要求5-7中任一项所述的构建枸杞DNA指纹图谱的方法,其特征在于,所述构建枸杞DNA指纹图谱的方法还包括:利用二维码技术将所述字符串形成二维码图形。
9.根据权利要求5-7中任一项所述的构建枸杞DNA指纹图谱的方法,其特征在于,所述PCR扩增的程序为:95℃预变性5min;95℃变性30s,60℃退火30s,72℃延伸30s,10个循环;95℃变性30s,50℃退火30s,72℃延伸30s,30个循环;95℃变性30s,53℃退火30s,72℃延伸30s,10个循环;72℃5min。
10.由权利要求5-9中任一项所述的构建枸杞DNA指纹图谱的方法所得到的枸杞DNA指纹图谱在鉴定枸杞种质资源中的应用。
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