[发明专利]一种长果安息香DNA提取方法在审
申请号: | 201611218103.0 | 申请日: | 2016-12-26 |
公开(公告)号: | CN107043765A | 公开(公告)日: | 2017-08-15 |
发明(设计)人: | 田晓明;颜立红;蒋利媛;范晓明;向光锋;欧阳泽怡 | 申请(专利权)人: | 湖南省森林植物园 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 北京弘权知识产权代理事务所(普通合伙)11363 | 代理人: | 逯长明,许伟群 |
地址: | 410116 湖南*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 安息香 dna 提取 方法 | ||
技术领域
本发明涉及植物DNA提取技术领域,尤其涉及一种长果安息香DNA提取方法。
背景技术
长果安息香(Sinojackia dolichocarpa)又名长果秤锤树,属落叶乔木或灌木,是一种融观花、观果与环保为一体的多功能树种和庭园绿化优良树种,同时也是我国极小种群保护树种。长果安息香主要分布于湖南石门和桑植的局部地区,野外种群数量少。由于长果安息香的分布区域狭小,生长环境独特,植株稀少,且近年来随着植被的破坏,因而,长果安息香的生长环境也随之改变,长果安息香的分布范围也日渐缩减,濒临灭绝。
一般而言,只有在弄清物种的遗传结构和遗传多样性现状的前提下,才能够制定出切实可行的保护策略,否则,任何物种保护措施的实施,都不会取得实质性的成效。分子标记能直接从DNA水平反映物种水平上的遗传差异,是研究植物遗传多样性的有效工具,因此,DNA提取是研究植物遗传多样性的关键环节。
由于次生代谢物的种类极其复杂,不同物种之间的次生代谢物有较大的区别,因此,同一种植物DNA提取方法往往不能很好的应用于不同种类的植物DNA的提取。目前,提取植物DNA的方法很多,最常见的提取方法是SDS(sodium dodecyl sulfate,sodium salt,即十二烷基硫酸钠)法和CTAB(Hexadecyl trimethyl ammonium Bromide,即十六烷基三甲基溴化铵)法,SDS法和CTAB法均能够对多数植物的DNA进行比较有效的提取。但对某些特定植物,或同一植物的不同器官部位,有的植物适于使用SDS法,有的植物适于使用CTAB法,且SDS法和CTAB法的提取效果有明显差异。然而,目前还没有一种植物DNA提取方法适用于长果安息香的DNA提取。
发明内容
为克服相关技术中存在的问题,本发明提供一种长果安息香DNA提取方法,通过本发明提供的DNA提取方法能够得到完整性好、纯度高的长果安息香DNA。
本发明提供一种长果安息香DNA提取方法,所述DNA提取方法包括:
S01:称取长果安息香放入研钵中,向所述研钵中加入液氮,研磨成粉末,将所述粉末放入离心管中;
S02:向所述离心管中加入体积比为50:1的2×CTAB缓冲液和β-巯基乙醇,混合均匀后形成混合液a;
S03:将所述混合液a放入65℃水浴中温育40-60min,温育后的所述混合液a离心,离心得到的上清液a备用;
S04:根据体积比为10:1混合所述上清液a和NaCl溶液,搅拌均匀后得到混合液b;
S05:根据体积比为1:1混合所述混合液b和溶剂,混匀形成混合液c,所述混合液c离心后留取上清液b,所述溶剂为氯仿与异戊醇的混合溶液;
S06:重复步骤S04-S05,直到无沉淀物,最后一次离心得到的上清液c备用;
S07:向所述上清液c中加入异丙醇,轻轻晃动至絮状物出现,离心,离心得到的沉淀物a备用;
S08:将所述沉淀物a用浓度为75%的酒精洗涤,离心,离心得到的沉淀物b备用;
S09:重复1-2次步骤S07-S08,最后一次离心得到的沉淀物c备用;
S10:向所述沉淀物c中加入体积比为100:1的灭菌NaCl溶液和RNaseA(Ribonuclease,即核糖核酸酶)溶液,混合均匀后置于37℃水浴中消化12-15h,得到混合液d;
S11:根据体积比为1:1混合所述混合液d和冰无水乙醇,慢慢水平转动离心管至产生絮状沉淀,离心,离心得到的沉淀物d备用;
S12:将所述沉淀物d放入离心管中,用浓度为75%的酒精洗涤10min,洗涤完毕后将酒精倒出,留取所述沉淀物d;
S13:向所述离心管中加入无水乙醇,洗涤,洗涤完毕后将酒精倒出,留取所述沉淀物d;
S14:将所述离心管倒置于干燥的灭菌滤纸上,室温干燥至所述沉淀物d透明;
S15:向干燥后的所述沉淀物d中加入TE缓冲液进行溶解,溶解后离心,离心得到的上清液d为长果安息香的DNA溶液,所述上清液d放置于-20℃的冰箱内保存,待用。
优选地,步骤S01中所述2×CTAB缓冲液为65℃预热的2×CTAB缓冲液,以使混合液a进行温育时能够快速达到温育的温度,缩短提取时间。
优选地,步骤S03中所述温育为将所述混合液a放入65℃水浴中40-60min,且每隔5min摇匀一次,以使混合液a中各物质的温育温度相同。
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