[发明专利]一种利用SSR标记信息提高林木遗传评估精确度的方法

权利要求书

1.一组能够提高林木遗传评估精确度的SSR标记，其特征在于，包括134对SSR标记，其上下游引物序列依次分别如SEQ ID NO.1～268所示。

2.权利要求1所述SSR标记在提高林木遗传评估精确度方面的应用。

3.一种利用SSR标记信息提高林木遗传评估精确度的方法，其特征在于，是采用SSR标记构建的G矩阵进行林木遗传评估，具体包括如下步骤：

S1：测定若干个待检测无性系苗所有个体的地径，形成表型数据；

S2：提取所有无性系的DNA，用134对SSR标记进行扩增，将扩增结果记录为0/1的SSR标记数据；

S3：根据SSR标记数据，计算无性系间的遗传一致性；

S4：根据无性系间的遗传一致性系数，计算其逆矩阵，作为无性系的G矩阵；

S5：对表型数据进行分析，结合S4构建的G矩阵，估算环境误差和遗传方差，分析公式为：

y=Xb+Zu+e

其中，y代表无性系个体地径的测量值，b代表固定效应值，u代表随机效应值，e代表残差效应，e包括测量误差；

S6：根据重复力公式计算求得重复力估计值，所述重复力公式为：

rep=Vc/Vp

其中rep代表重复力，Vc为无性系遗传方差，Vp为表型方差。

4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，步骤S5中，利用ASReml-R软件对试验数据进行分析，同时结合S4构建的G矩阵，从而估算遗传方差和环境误差。

5.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，步骤S3中，利用NTsys软件对SSR标记数据进行分析，从而计算无性系间的遗传一致性。

6.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，步骤S1中，所述待检测无性系为桉树无性系。

7.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，步骤S2中，所述134对SSR 标记即为134对SSR引物，其上下游引物序列依次分别如SEQ ID NO.1～268所示。

8.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，包括如下步骤：

S1：试验材料为桉树无性系5个月盆栽苗，参试无性系共11个，每个无性系10棵盆栽苗；对全部盆栽苗进行地径的测量，获得每个个体地径的测量值；

S2：提取全部无性系的基因组DNA，通过134对SSR引物进行扩增，选择清晰、可重复的条带统计，数据录入方式：有条带记为1，无条带记为0，建立SSR标记数据矩阵；

S3：对SSR标记数据矩阵，通过NTsys 2.10e软件计算无性系间的遗传一致性系数矩阵；

S4：对遗传一致性系数矩阵，通过R-3.2.1软件计算无性系间的遗传一致性逆矩阵，作为无性系的G矩阵；

S5：利用ASReml-R软件精确估算遗传方差：y=Xb+Zu+e

其中y代表无性系个体地径的测量值，b代表固定效应值，u代表随机效应值，e代表残差效应；

S6：再根据重复力公式计算求得重复力估计值：rep=V_c/V_p

其中rep代表重复力，V_c为遗传方差，V_p为表型方差。