[发明专利]用于组合条形编码的方法和组合物在审
申请号: | 201680015745.2 | 申请日: | 2016-03-29 |
公开(公告)号: | CN107406888A | 公开(公告)日: | 2017-11-28 |
发明(设计)人: | 格伦·弗;斯蒂芬·P·A·福多尔 | 申请(专利权)人: | 赛卢拉研究公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京安信方达知识产权代理有限公司11262 | 代理人: | 王玮玮,郑霞 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 组合 条形 编码 方法 | ||
1.一种组合物,该组合物含有用于产生一组组合条形码的一组分量条形码,该组分量条形码包括:
n x m个单一分量条形码,其中n和m是正整数,每个分量条形码包括:
n个单一条形码亚单位序列中的一者;和
一种或两种接头序列或其互补序列,
其中将这些分量条形码配置为通过该一种或两种接头序列或其互补序列彼此连接,从而产生一组组合条形码。
2.如权利要求1所述的组合物,其中该n个单一条形码亚单位序列组中的每一个单一条形码亚单位序列包括分子标记、细胞标记、维度标记、通用标记、或其任何组合。
3.如权利要求1或2所述的组合物,其中不同接头序列的总数是m-1或m-2。
4.如权利要求1-3中任一项所述的组合物,其中每个分量条形码包括:
a)条形码亚单位序列-接头;
b)接头-条形码亚单位序列-接头的互补序列;或
c)接头-条形码亚单位序列的互补序列。
5.如权利要求1-4中任一项所述的组合物,其中该组组合条形码中的每一个包括寡核苷酸,该寡核苷酸包含构造式:条形码亚单位序列a-接头1-条形码亚单位序列b-接头2-…条形码亚单位序列c-接头m-1-条形码亚单位序列d。
6.如权利要求5所述的组合物,其中该寡核苷酸包括靶特异性区。
7.如权利要求6所述的组合物,其中该靶特异性区是寡聚dT。
8.如权利要求1-4中任一项所述的组合物,其中该组组合条形码中的每一个包括:
第一寡核苷酸,其包含构造式:条形码亚单位序列a-接头1-条形码亚单位序列b-接头2-…-条形码亚单位序列c;和
第二寡核苷酸,其包含条形码亚单位序列d-…-接头3-条形码亚单位序列e-接头m-2-条形码亚单位序列f。
9.如权利要求8所述的组合物,其中该第一寡核苷酸和第二寡核苷酸中的每一个包括靶特异性区。
10.如权利要求9所述的组合物,其中这些靶特异性区中的一者是寡聚dT。
11.如权利要求1-10中任一项所述的组合物,其中该一种或两种接头序列中的每一个是不同的。
12.如权利要求1-11中任一项所述的组合物,其中m是从2至10的整数。
13.如权利要求1-11中任一项所述的组合物,其中m是从2至4的整数。
14.如权利要求1-13中任一项所述的组合物,其中n是从4至100的整数。
15.如权利要求1-13中任一项所述的组合物,其中n=24。
16.如权利要求1-15中任一项所述的组合物,其中该n个单一条形码亚单位序列具有相同的长度。
17.如权利要求1-15中任一项所述的组合物,其中该n个单一条形码亚单位序列中至少两个具有不同的长度。
18.如权利要求1-17中任一项所述的组合物,其中这些接头序列具有相同的长度。
19.如权利要求1-17中任一项所述的组合物,其中这些接头序列具有不同的长度。
20.如权利要求1-19中任一项所述的组合物,其中该组组合条形码具有等于或小于nm个的单一组合条形码。
21.如权利要求1-19中任一项所述的组合物,其中该组组合条形码具有至少100,000个单一组合条形码。
22.如权利要求1-19中任一项所述的组合物,其中该组组合条形码具有至少200,000个单一组合条形码。
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