[发明专利]用于测定胃肠道菌群失调的方法

权利要求书

1.一种用于测定个体的胃肠道菌群失调的可能性的方法，所述方法包含：

(i)提供测试数据集，其中所述测试数据集包含至少一个微生物群分布，所述微生物群分布为来自所述个体的胃肠道的样品中的多种微生物或微生物群组的相对水平的分布且其中每一微生物或微生物群组的每一水平为所述测试数据集的分布元素，

(ii)向所述测试数据集应用至少一个负荷矢量，其中所述至少一个负荷矢量是由来自多个正常个体的对应胃肠道样品中的所述多种微生物或微生物群组的水平的回归分析测定的至少一种正交潜在变量，从而产生第一投影数据集，

(iii)提供所述第一投影数据集，

(iv)由所述第一投影数据集计算所述微生物群分布的Q残差且将所述微生物群分布的Q残差与由来自多个正常个体和/或菌群失调个体的对应胃肠道样品中的所述多种微生物或微生物群组的对应分析测定的菌群正常到菌群失调阈值Q残差值进行比较，

(v)由所述第一投影数据集计算步骤(ii)的由来自多个正常个体的对应胃肠道样品中的所述多种微生物或微生物群组的水平的回归分析测定的正交潜在变量所解释的方差的微生物群分布的霍特林T²且对微生物群分布的所述霍特林T²与由来自多个正常个体和/或多个菌群失调个体的对应胃肠道样品中的所述多种微生物或微生物群组的对应分析测定的菌群正常到菌群失调阈值霍特林T²值进行比较，

其中步骤(v)可在步骤(iv)之前或之后或同时进行，且其中具有超过各别阈值的Q残差或霍特林T²的微生物群分布说明菌群失调的可能性。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述方法进一步包含前述步骤，其中制备所述微生物群分布中的至少一者。

3.根据权利要求1所述的方法，其中所述测试数据集包含多个微生物群分布且所述测试数据集排列成矩阵。

4.根据权利要求1所述的方法，其中所述正交潜在变量通过正交变换成来自多个正常个体的对应胃肠道样品中的所述多种微生物或微生物群组的水平的主成分来测定。

5.根据权利要求4所述的方法，其中所述正交变换成主成分通过偏最小平方回归分析、主成分分析、典范相关性分析、冗余分析、对应性分析和典范对应性分析中的至少一者进行。

6.根据权利要求1到5中任一权利要求所述的方法，其中应用至少2个负荷矢量和/或不超过50个负荷矢量。

7.根据权利要求6所述的方法，其中应用至少3、5、7、9、11、13、15、17、19或20个负荷矢量。

8.根据权利要求6所述的方法，其中应用不超过40、30、25、20或15个负荷矢量。

9.根据权利要求1到5中任一权利要求所述的方法，其中所述负荷矢量以投影矩阵形式应用。

10.根据权利要求1到5中任一权利要求所述的方法，其中所述微生物群分布为定量或半定量的且其中所述方法提供菌群失调程度的定量或半定量量度。

11.一种用于定量菌群失调的方法，所述方法包含进行根据权利要求10所述的方法，其中与菌群正常到菌群失调阈值一起的所述比较包含将步骤(iv)的Q残差和步骤(v)的霍特林T²组合成菌群失调的单一度量。

12.根据权利要求11所述的方法，其中计算离步骤(iv)的Q残差和步骤(v)的霍特林T²两者原点的欧几里得(Euclidean)距离。

13.根据权利要求12所述的方法，其中用式I计算离Q残差和霍特林T²两者原点的欧几里得距离：