[发明专利]菌落对比度收集有效
申请号: | 201680022999.7 | 申请日: | 2016-04-22 |
公开(公告)号: | CN107771212B | 公开(公告)日: | 2021-09-10 |
发明(设计)人: | T·M·威尔斯;R·R·玛赛珀利 | 申请(专利权)人: | BD科斯特公司 |
主分类号: | C12M1/00 | 分类号: | C12M1/00;C12M1/22;C12M1/34;C12M1/36;G06K9/00;G06K9/46;G06K9/62;G06T7/00;G06T7/11;G06T7/13;G06T7/30;G06T7/60;G06T7/90;G06T3/00 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 赵蓉民;张全信 |
地址: | 荷兰,*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 菌落 对比度 收集 | ||
1.一种自动化方法,其用于评估铺板培养基上的微生物生长,所述方法包括:
提供布置在光学透明的容器内的用生物样品接种的培养基;
在培育箱中孵育接种的培养基;
将携带所述接种的培养基的所述透明容器放置在数字成像仪器内;
在第一时间(t0)获得所述接种的培养基的第一数字图像,所述第一数字图像具有多个像素;
确定所述第一数字图像中的像素相对于携带所述接种的培养基的透明容器的坐标;
将所述携带接种的培养基的透明容器从所述数字成像仪器中移除,并且将所述接种的培养基放置在所述培育箱中用于进一步的孵育;
在进一步的孵育之后,将所述携带接种的培养基的透明容器放置在所述数字成像仪器内;
在第二时间(tx)获得所述接种的培养基的第二数字图像,所述第二数字图像具有多个像素;
将所述第一数字图像与所述第二数字图像对齐,从而所述第二数字图像中的像素的坐标相应于所述第一数字图像中相应像素的坐标;
比较所述第二数字图像的像素与所述第一数字图像的相应像素;
鉴定在所述第一数字图像和所述第二数字图像之间变化的像素,其中在所述第一数字图像和所述第二数字图像之间没有变化的像素指示背景;
确定所述第二数字图像中哪些鉴定的像素与指示背景的像素具有预定水平的阈值对比度;
鉴定所述第二数字图像中的一个或者多个目标,每个目标由满足所述水平的阈值对比度的像素组成,并且其彼此不被背景像素隔开;
对于所述鉴定的目标的至少一个,通过从与所述目标相关联的像素信息中获得目标特征,从所述目标的像素确定所述目标的形态,其中所述目标特征包括目标形状、目标大小、目标边缘和目标颜色中的至少一种,其中所述目标的形态基于所述目标特征确定;并且
从所述目标的形态,确定所述目标是否为菌落候选;并且
提供与所述目标相关联的所述像素的坐标至存储器。
2.如权利要求1所述的方法,进一步包括根据预定系列的照明条件,在所述第一时间获得多个第一数字图像,其中所述第一数字图像的每个都在不同的照明条件下获得,每个照明条件包括携带所述接种的培养基的所述光学透明容器相对于照明源的指定的朝向,以及指定的背景颜色,在所述指定的背景颜色上将所述光学透明容器放置在所述成像仪器内。
3.如权利要求2所述的方法,其中所述指定的朝向包括:
所述照明源向下指向所述携带接种的培养基的所述光学透明容器的顶部;
所述照明源向上指向所述携带接种的培养基的所述光学透明容器的底部;以及
所述照明源指向所述携带接种的培养基的所述光学透明容器的侧面。
4.如权利要求3所述的方法,其中对于所述指定的顶部和侧面朝向,所述指定的背景颜色是黑色;并且对于所述指定的底部朝向,所述指定的背景颜色是白色。
5.如权利要求4所述的方法,其中所述每种照明条件进一步包括指定的照明光谱,其包括:
发射红色波长的照明源;
发射绿色波长的照明源;以及
发射蓝色波长的照明源。
6.如权利要求1所述的方法,其中目标颜色由与所述目标相关联的像素的光谱特征确定。
7.如权利要求6所述的方法,其中所述光谱特征选自像素颜色、色调、照度和色度。
8.如权利要求1所述的方法,进一步包括获得背景特征信息,其中背景特征信息包括培养基类型和培养基颜色,其中所述目标的形态进一步基于所述背景特征信息确定。
9.如权利要求8所述的方法,进一步包括:
将所述目标特征和背景特征信息与储存在存储器中的目标特征和背景特征信息比较;并且
基于所述目标特征和背景特征信息确定微生物的类型。
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