[发明专利]用于预测蛋白质的至少一个适应度值的方法和电子系统

说明书

将用于预测蛋白质的至少一个适应度值的方法在计算机上执行，并且所述方法包括以下步骤：根据蛋白质数据库将所述蛋白质的氨基酸序列编码(100)成数值序列，所述数值序列包含序列中每个氨基酸的值；根据数值序列计算(110)蛋白质谱；以及对于每个适应度：将计算的蛋白质谱与预定数据库的蛋白质谱值进行比较(130)，所述数据库包含针对所述适应度的不同值的蛋白质谱值，根据比较步骤预测(130)所述适应度的值。

本发明涉及用于预测蛋白质的至少一个适应度值(fitness value)的方法和相关的电子系统，所述蛋白质包含氨基酸序列。本发明还涉及包括软件指令的计算机程序产品，所述程序产品被计算机执行，当被计算机执行时，所述程序产品执行这种方法。

发明背景

蛋白质是由至少一个氨基酸序列链组成的生物分子。蛋白质彼此相异主要在于它们的氨基酸序列，序列之间的差异被称为“突变”。

蛋白质工程的最终目标之一是具有所需性质(统称为“适应度”)的肽、酶、蛋白质或氨基酸序列的设计和构建。用工程化的氨基酸置换、氨基酸的缺失或插入或氨基酸嵌段(嵌合蛋白质)修饰的氨基酸序列(即“突变体”)的构建允许评估任何特定氨基酸在适应度中的作用以及了解蛋白质结构与其适应度之间的关系。

定量结构-功能/适应度关系分析的主要目的是调查和数学地描述蛋白质结构变化对其适应度的影响。突变的影响与不同氨基酸的物理化学和其它分子性质相关，并且可通过统计学分析来逼近。

探索适应度景观，调查n个单点置换的所有可能的组合(排列)是一项非常困难的任务。确实，突变体的数量增加非常快(表1)。

单点突变的数目	突变体的数目
2	4
4	16
6	64
8	256
10	1024
12	4096
14	16384
16	65536
40	12]]>