[发明专利]与大豆的疫霉根腐病相关联的遗传基因座

说明书

本发明主题涉及用于鉴定具有增加的疫霉根腐病抗性的大豆植物的方法和组合物。所述方法使用分子标记来鉴定和选择具有增加的疫霉根腐病抗性的植物或来鉴定和取消选择具有降低的疫霉根腐病抗性的植物。通过公开的方法生成的大豆植物也是本发明主题的特征。

相关申请的交叉引用

本申请要求提交于2015年6月3日的美国临时申请号62/170,441的优先权，该临时申请以引用方式整体并入本文。

对以电子方式提交的序列表的引用

序列表的正式拷贝以电子方式经由EFS-Web作为ASCII格式的序列表提交，其文件名为“77970-WO-PCT_ST25_SEQUENCE_LISTING.txt”，于2016年6月1日创建，大小为15.7千字节，并与本申请同时提交。该ASCII格式文件中所含的序列表是说明书的一部分，并以引用方式整体并入本文。

技术领域

本公开主题涉及可用于增加大豆植物的疫霉根腐病(Phytophthoraroot andstem rot)抗性的方法。

背景技术

自从在1948年在印第安纳州首次被注意并在1951年在俄亥俄州再次被注意(Dorrance等人2007；Erwin和Ribeiro 1996；Kaufmann和Gerdemann 1958；Schmitthenner1985)，由土传病原体大豆疫霉(Phytophthora sojae)引起的疫霉根腐病(PRSR)在全世界大多数大豆生产地区都有报道。从1996年到2009年，在美国PRSR被排名为位居抑制大豆产量的大豆孢囊线虫病(SCN)之后的第二最具破坏性大豆病害，其导致年度产量损失达4470万bu(Koenning和Wrather 2010；Wrather和Koenning 2009)。

生理小种(race)特异抗性大豆栽培品种的部署一直是PRSR管理的主要策略，因为它在降低由疫霉病导致的大豆产量损失方面是高效且经济和环境安全的(Dorrance等人2007；Dorrance和Schmitthenner 2000；Schmitthenner 1999)。迄今为止，已经鉴定了大约25个Rps基因/等位基因，其分布在八个不同染色体上的19个座位处。3号染色体(Chr.3)(MLG N)具有作图(mapped)最多的Rps基因/等位基因，包括Rps1a、Rps1b、Rps1c、Rps1d、Rps1k、Rps7、Rps9、RpsUN1、RpsYu25、RpsYD29和日本栽培品种'Waseshiroge'中报道的未命名Rps基因(Demirbas等人2001；Fan等人2009；Gao等人2005；Lin等人2013；Sugimoto等人2011；Sun等人2011；Weng等人2001；Wu等人2011a；Yao等人2010；Zhang等人2013)。两个Rps基因即Rps2和RpsUN2已作图在Chr.16(MLG J)的末端处，该Chr.16是熟知的抗性基因簇区(Kanazin等人1996；Lin等人2013；Polzin等人1994)。有趣的是，Rps3(含有三个等位基因3-a、3-b、3-c)和Rps 8已被作图到Chr。13(MLG F)上的另一抗性基因富含区(Demirbas等人2001；Gordon等人2006)。最近鉴定出的Rps基因RpsJS与Rps4、Rps5和Rps6连锁并且全部位于Chr.18(MLG F)的短臂上(Demirbas等人2001；Sandhu等人2004；Sun等人2014)。此外RpsYB30、Rps ZS18、RpsSu和Rps10已分别被作图到Chr.19(MLG L)、Chr.2(MLG D1b)、Chr.10(MLG O)和Chr.17(MLG D2)(Wu等人2011b；Yao等人2010；Zhang等人2013；Zhu等人2007)。