[发明专利]用于诊断或检测肺癌的方法和组合物在审
申请号: | 201680035039.4 | 申请日: | 2016-05-19 |
公开(公告)号: | CN107709636A | 公开(公告)日: | 2018-02-16 |
发明(设计)人: | L·C·肖维;M·K·肖维;A·V·科森科夫 | 申请(专利权)人: | 威斯塔解剖学和生物学研究所 |
主分类号: | C40B30/04 | 分类号: | C40B30/04 |
代理公司: | 北京英赛嘉华知识产权代理有限责任公司11204 | 代理人: | 王达佐,洪欣 |
地址: | 美国宾夕*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 诊断 检测 肺癌 方法 组合 | ||
1.一种用于诊断肺癌的多分析物组合物,其包含:
(a)配体,所述配体选自能够与来自哺乳动物生物样本的mRNA基因转录物特异性复合、与所述转录物杂交或鉴别所述转录物的核酸序列、多核苷酸或寡核苷酸;和
(b)另外的配体,所述另外的配体选自能够与来自哺乳动物生物样本的miRNA特异性复合、与所述miRNA杂交或鉴别所述miRNA的核酸序列、多核苷酸或寡核苷酸;
其中每种配体和另外的配体与不同的基因转录物或miRNA结合,且所鉴别的所述基因转录物和miRNA的组合表达水平形成肺癌或肺癌分期的特征谱。
2.根据权利要求1所述的组合物,其中所述基因转录物和miRNA选自表1或表2或表3。
3.根据权利要求2所述的组合物,其中所述基因转录物和miRNA选自表1的排序1至119。
4.根据权利要求1所述的组合物,其中每种所述配体是扩增和检测所述基因转录物或miRNA的核酸序列的扩增核酸引物或引物对、与所述基因的mRNA或miRNA核酸序列杂交的多核苷酸探针、或抗体或抗体片段,每种配体对表1或表2或表3中的至少一个mRNA或一个miRNA具有特异性。
5.根据权利要求1所述的组合物,其还包含所述配体固定在其上的基板、微阵列、微流体卡、芯片、腔室或多个探针的复合物,或包含多个探针序列的试剂盒,至少一个所述探针序列能够与表1、表2或表3的所述mRNA和miRNA靶标中的一个mRNA杂交且至少一个探针能够与一个miRNA杂交;或还包含能够与相同的mRNA或miRNA杂交的另外的配体的试剂盒;或包含多个所述配体的试剂盒,所述多个配体各自包含多核苷酸或寡核苷酸引物-探针组,并且其中所述试剂盒包含引物和探针两者,其中每个所述引物-探针组扩增不同的基因转录物或miRNA。
6.根据权利要求1所述的组合物,其中一种或多种多核苷酸或寡核苷酸或配体与可检测的标记相关联。
7.根据权利要求1所述的组合物,其中所述组合物能够检测受试者全血中相同的选定基因和miRNA的表达、表达水平或活性相比于参考或对照的变化,其中所述变化与肺癌的初始诊断、肺癌的分期、肺癌的类型或分类、肺癌的复发、肺癌的消退、肺癌的预后、或肺癌对手术或非手术疗法的反应相关。
8.根据权利要求1所述的组合物,其中所述组合物能够检测受试者血液中相同的选定基因中的表达相比于参考或对照的变化,其中所述变化与肺癌的诊断或评估相关。
9.根据权利要求1所述的组合物,其中所述配体为RNA引物。
10.根据权利要求1所述的组合物,其为包含至少两种配体的试剂盒或微阵列,至少一种配体鉴别当所述受试者具有肺癌时在表达上具有改变的选定基因的mRNA转录物,且至少第二配体鉴别当所述受试者具有肺癌时在表达水平上具有变化的miRNA。
11.一种用于增加在哺乳动物受试者中的测定的灵敏度和特异性的方法,其包括鉴别在哺乳动物受试者的生物流体中至少一种mRNA靶标和至少一种miRNA靶标的组合的表达相比于来自参考或对照的相同生物样本中mRNA和miRNA靶标的相同组合的表达水平的变化。
12.根据权利要求11所述的方法,其包括使用根据权利要求1所述的多分析物组合物。
13.根据权利要求11所述的方法,其中所述诊断或评估包括以下一种或多种:肺癌、良性肺结节的诊断、肺癌分期的诊断、肺癌的类型或分类的诊断、肺癌复发的诊断或检测、肺癌消退的诊断或检测、肺癌的预后、或肺癌对手术或非手术疗法的反应的评估、或早期肺癌的诊断或作为I期或II期非小细胞肺癌的肺癌的诊断;或者其中所述选定的miRNA和mRNA在选自以下的两种或更多种病状中差异表达:无吸烟史无肺病、有吸烟史无肺病、肺癌、慢性阻塞性肺部疾病(COPD)、良性肺结节、肿瘤切除前的肺癌和肿瘤切除后的肺癌。
14.根据权利要求11所述的方法,其中所述变化包括与所述参考或对照相比较一种或多种选定基因转录物的上调或下调和与所述参考或对照相比较一种或多种选定miRNA的上调或下调的组合。
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