[发明专利]癌症新表位

权利要求书

1.产生用于癌症免疫治疗的药剂的方法，其包括：

使用肿瘤的匹配的正常组学数据在计算机上生成包含至少一种患者特异性且癌症特异性的癌症新表位的多种n聚体；

在计算机上过滤所述n聚体以获得新表位序列的子集；

使用来自所述新表位序列的子集的序列信息制备至少一种合成的n聚体肽；

使用所述合成的n聚体肽分离重组抗体；

获得所述重组抗体的互补决定区的序列信息；

使用所述重组抗体的互补决定区的序列信息产生合成抗体；以及

将所述合成抗体偶联至治疗剂或诊断剂以获得所述药剂。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述匹配的正常组学数据是全基因组测序数据、外显子组测序数据和转录组数据中的至少一个。

3.根据权利要求1所述的方法，其中所述匹配的正常组学数据在患者治疗之前与正常情况相匹配。

4.根据权利要求1所述的方法，其中所述多种n聚体肽中的每一种具有7-11个氨基酸的长度。

5.根据权利要求1所述的方法，其中所述多种n聚体肽是至少1,000种n聚体肽。

6.根据权利要求1所述的方法，其中所述多种n聚体肽中的不同n聚体肽具有不同的新表位。

7.根据权利要求1所述的方法，其中所述过滤步骤包括以下中的至少一种：通过突变类型进行过滤、通过表达强度进行过滤、通过亚细胞定位进行过滤以及通过对患者的HLA-型的结合亲和力进行过滤。

8.根据权利要求1所述的方法，其中所述过滤步骤包括以下中的至少两种：通过突变类型进行过滤、通过表达强度进行过滤、通过亚细胞定位进行过滤以及通过对所述患者的HLA-型的结合亲和力进行过滤。

9.根据权利要求1所述的方法，其中所述过滤步骤包括以下中的至少三种：通过突变类型进行过滤、通过表达强度进行过滤、通过亚细胞定位进行过滤以及通过对所述患者的HLA-型的结合亲和力进行过滤。

10.根据权利要求1所述的方法，其中使用所述合成的n聚体肽分离重组抗体的步骤包括噬菌体淘选。

11.根据权利要求10所述的方法，其中所述噬菌体淘选的步骤还包括亲和力成熟。

12.根据权利要求1所述的方法，其中所述重组抗体的互补决定区的序列信息包括CDR1-H、CDR2-H和CDR3-H。

13.根据权利要求1所述的方法，其中所述合成抗体通过将CDR或SDR移植到人抗体支架上来产生。

14.根据权利要求1所述的方法，其中所述合成抗体通过重组表达作为IgG、F(ab′)₂、Fab′、Fab或scFv产生。

15.根据权利要求1所述的方法，其中所述治疗剂或诊断剂是非细胞剂。

16.根据权利要求15所述的方法，其中所述非细胞剂是化学治疗药物、放射性同位素、PET可检测同位素、SPECT可检测同位素或亲和剂。

17.根据权利要求1所述的方法，其中所述治疗剂是细胞。

18.根据权利要求17所述的方法，其中所述细胞是T细胞或NK细胞。

19.根据权利要求18所述的方法，其中所述细胞是表达嵌合受体的T细胞，所述嵌合受体具有作为胞外域的scFv，并且其中所述合成抗体是scFv。