[发明专利]癌组织的异质性标记物及其使用

说明书

技术领域

本发明涉及癌组织的异质性标记物及其使用。更具体地，涉及用于判定癌组织是否包含异质的癌细胞群体的判定用基因标记物、蛋白质标记物、试剂盒以及判定癌组织样品是否包含异质的癌细胞群体的判定方法。本申请要求2015年7月1日在日本申请的日本特愿2015-133033号的优先权，并在此引用其内容。

背景技术

已知在一个癌组织中混有性质不同的癌细胞的情况。在这种状态下，称为肿瘤内异质性(intratumor heterogeneity)，被认为是难以进行癌治疗的一个原因(例如，参照非专利文献1)。

现有技术文献

非专利文献

非专利文献1：Inda M.M.,et al.,Tumor heterogeneity is an active process maintained by a mutant EGFR-induced cytokine circuit in glioblastoma.,Genes Dev.,24(16),1731-1745,2010.

发明内容

当前，还不存在用于判定癌组织的异质性(癌组织包含异质的癌细胞群体的状态)的方法。因此，本发明的目的在于提供用于判定癌组织是否包含异质的癌细胞群体的判定用基因标记物。另外，本发明的目的还在于提供用于判定癌组织是否包含异质的癌细胞群体的判定用蛋白质标记物、癌组织是否包含异质的癌细胞群体的判定用试剂盒以及癌组织是否包含异质的癌细胞群体的判定方法。

本发明如下所述。

(1)一种判定用基因标记物，用于判定癌组织是否包含异质的癌细胞群体，所述判定用基因标记物从钙调蛋白样蛋白3(CALML3)、双糖链蛋白聚糖(BGN)、氯离子通道辅助蛋白2(CLCA2)、半胱氨酸蛋白酶抑制剂A(CSTA)、醛脱氢酶1家族成员A1(ALDH1A1)、神经生长因子受体(NGFR)、S100钙结合蛋白A8(S100A8)、弹性蛋白(ELN)、SNRPN上游读框(SNURF)以及半乳凝素-7(LGALS7)所构成的组中选择。

(2)一种判定用蛋白质标记物，用于判定癌组织是否包含异质的癌细胞群体，所述判定用蛋白质标记物由从CALML3、BGN、CLCA2、CSTA、ALDH1A1、NGFR、S100A8、ELN、SNURF以及LGALS7所构成的组中选择的基因编码。

(3)一种癌预后判定用标记物，所述癌预后判定用标记物由从CALML3、BGN、CLCA2、CSTA、ALDH1A1、NGFR、S100A8、ELN、SNURF以及LGALS7所构成的组中选择的基因或者所述基因编码的蛋白质构成。

(4)一种判定用试剂盒，用于判定癌组织是否包含异质的癌细胞群体，所述判定用试剂盒包括：引物组，用于扩增从CALML3、BGN、CLCA2、CSTA、ALDH1A1、NGFR、S100A8、ELN、SNURF以及LGALS7所构成的组中选择的至少一种基因的cDNA；探针，与从CALML3、BGN、CLCA2、CSTA、ALDH1A1、NGFR、S100A8、ELN、SNURF以及LGALS7所构成的组中选择的至少一种基因的mRNA特异性杂交；或者针对由从CALML3、BGN、CLCA2、CSTA、ALDH1A1、NGFR、S100A8、ELN、SNURF以及LGALS7所构成的组中选择的至少一种基因编码的蛋白质的特异性结合物质。

(5)一种癌预后判定用试剂盒，包括：引物组，用于扩增从CALML3、BGN、CLCA2、CSTA、ALDH1A1、NGFR、S100A8、ELN、SNURF以及LGALS7所构成的组中选择的至少一种基因的cDNA；探针，与从CALML3、BGN、CLCA2、CSTA、ALDH1A1、NGFR、S100A8、ELN、SNURF以及LGALS7所构成的组中选择的至少一种基因的mRNA特异性杂交；或者针对由从CALML3、BGN、CLCA2、CSTA、ALDH1A1、NGFR、S100A8、ELN、SNURF以及LGALS7所构成的组中选择的至少一种基因编码的蛋白质的特异性结合物质。

(6)一种判定方法，用于判定癌组织样品是否包含异质的癌细胞群体，包括：检测工序，检测癌组织样品中的从CALML3、BGN、CLCA2、CSTA、ALDH1A1、NGFR、S100A8、ELN、SNURF以及LGALS7所构成的组中选择的至少一种基因的表达；以及判定工序，在检测到所述基因的表达的情况下，判定所述癌组织样品包含异质的癌细胞群体。

(7)根据(6)所述的判定方法，所述检测工序通过检测所述基因的mRNA来进行。