[发明专利]用于预测沙门氏菌属物种对抗微生物剂的抗性的基因测试在审
| 申请号： | 201680038540.6 | 申请日： | 2016-07-21 |
| 公开（公告）号： | CN108271394A | 公开（公告）日： | 2018-07-10 |
| 发明（设计）人： | 安德烈亚斯·凯勒;苏珊娜·施默尔克;科德·弗里德里希·施塔勒;克里斯蒂娜·巴克斯;瓦伦蒂娜·加拉塔 | 申请（专利权）人： | 阿瑞斯遗传股份有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/689 | 分类号： | C12Q1/689 |
| 代理公司： | 北京英赛嘉华知识产权代理有限责任公司 11204 | 代理人： | 王达佐;洪欣 |
| 地址： | 奥地利*** | 国省代码： | 奥地利;AT |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 沙门氏菌属物种 抗生素抗性 抗性 计算机程序产品 沙门氏菌属 微生物药物 细菌微生物 报告结果 分子指纹 患者感染 基因测试 微生物剂 对抗 治疗 文库 采集 测试 参考 感染 预测 申请 | ||
1.确定患者感染对抗微生物药物如抗生素的治疗可能具有抗性的沙门氏菌属(Salmonella)物种的诊断方法，其包括下述步骤：
a)获得或者提供来自所述患者的包含或疑似包含至少一种沙门氏菌属物种的样品；
b)确定来自下述基因的至少两种基因中至少一个突变的存在：recN、hemH、UMN798_3428、metE、yijD、UMN798_4831、UMN798_1939、copS、UMN798_0628、UMN798_4878、leuB、recF、emrA、glyQ、dcp、thiH、UMN798_1612、UMN798_2909、UMN798_1680、UMN798_4073、yjbC、nadB、UMN798_3160、hutU、envC、UMN798_3889、UMN798_1629、bcfB、degQ、UMN798_1331、trg、uvrC、polB、hpcD、UMN798_1628、UMN798_1701、glgS、plsB、yjcC、feoB、misL、dxr、hemF、rnfG、yhjB、UMN798_1163、UMN798_0394、alkA、nhaA和lspA，其中存在所述至少两个突变表明所述患者感染了具有抗微生物药物抗性如抗生素抗性的沙门氏菌属菌株。
2.选择对感染了可能具有抗性的沙门氏菌属菌株的患者的治疗的方法，其包括下述步骤：
a)获得或提供来自所述患者的包含或疑似包含至少一种沙门氏菌属物种的样品；
b)确定来自下述基因的至少两种基因中至少一个突变的存在：recN、hemH、UMN798_3428、metE、yijD、UMN798_4831、UMN798_1939、copS、UMN798_0628、UMN798_4878、leuB、recF、emrA、glyQ、dcp、thiH、UMN798_1612、UMN798_2909、UMN798_1680、UMN798_4073、yjbC、nadB、UMN798_3160、hutU、envC、UMN798_3889、UMN798_1629、bcfB、degQ、UMN798_1331、trg、uvrC、polB、hpcD、UMN798_1628、UMN798_1701、glgS、plsB、yjcC、feoB、misL、dxr、hemF、rnfG、yhjB、UMN798_1163、UMN798_0394、alkA、nhaA和lspA，其中存在所述至少两个突变表明对一种或多种抗微生物药物如抗生素类药物的抗性；
c)鉴定所述至少一种或多种抗微生物药物，例如抗生素类药物；以及
d)选择不同于步骤c)中所鉴定的药物并且适用于治疗沙门氏菌属感染的一种或多种抗微生物药物，例如抗生素类药物。
3.如前述权利要求中的一项或多项所述的方法，其中所述方法包括确定沙门氏菌属对一种或多种抗微生物药物，例如抗生素类药物的抗性。
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