[发明专利]用于癌症治疗和预防的疫苗

权利要求书

1.包含至少两种不同的与抗原肽结合的纯化应激蛋白的复合物的第一组合物，其中所述复合物各自包含不同的抗原肽，其中所述每种不同的抗原肽包含一个或多个来自癌细胞的突变MHC-结合表位，并且其中所述组合物包含不超过5种不同的只含野生型MHC-结合表位的抗原肽。

2.权利要求1的组合物，其不包含任何只含野生型MHC-结合表位的抗原肽。

3.权利要求1或2的组合物，其包含不超过100种不同的抗原肽。

4.权利要求1的组合物，其中每种所述抗原肽以500nM或更低的IC₅₀结合MHC分子。

5.权利要求1的组合物，其中至少一种所述抗原肽以500nM或更低的IC₅₀结合MHC I分子。

6.权利要求1的组合物，其中至少一种所述抗原肽以1000nM或更低的IC₅₀结合MHC II分子。

7.权利要求4-6任一项的组合物，其中所述MHC分子是人MHC分子。

8.前述任一项权利要求的组合物，其中至少一种所述抗原肽包含超过一个来自癌细胞的突变MHC-结合表位。

9.前述任一项权利要求的组合物，其中至少一种所述抗原肽以低于500nM的IC₅₀结合超过一个不同的MHC分子。

10.前述任一项权利要求的组合物，其中至少一个所述突变MHC-结合表位在受试者的癌细胞中表达，但不在所述受试者的正常细胞中表达。

11.前述任一项权利要求的组合物，其中每个所述突变MHC-结合表位在单个受试者的癌细胞中表达，但不在所述受试者的正常细胞中表达。

12.前述任一项权利要求的组合物，其中相对于受试者的正常细胞，至少一个所述突变MHC-结合表位以较高水平在所述受试者的癌细胞中表达。

13.前述任一项权利要求的组合物，其中至少一个所述突变MHC-结合表位包含氨基酸突变或基因融合突变。

14.权利要求13的组合物，其中所述氨基酸突变是氨基酸置换、删除或插入。

15.权利要求13的组合物，其中所述氨基酸突变以高于0.05的等位基因频率存在于受试者的肿瘤中。

16.前述任一项权利要求的组合物，其中至少一个所述突变MHC-结合表位包含修饰的氨基酸。

17.权利要求16的组合物，其中所述修饰的氨基酸是已经在侧链羟基或胺上磷酸化的Tyr、Ser、Thr、Arg、Lys或His。

18.权利要求16的组合物，其中所述修饰的氨基酸是已经在侧链羟基或胺上磷酸化的Tyr、Ser、Thr、Arg、Lys或His氨基酸的模拟物。

19.前述任一项权利要求的组合物，其中至少一个所述突变MHC-结合表位在相同适应症的多个癌症中具有高于1个每千碱基转录产物阅读片段数/百万作图阅读片段数(RPKM)的中值表达水平。

20.前述任一项权利要求的组合物，其中每个所述突变MHC-结合表位在相同适应症的多个癌症中具有高于5个每千碱基转录产物阅读片段数/百万作图阅读片段数(RPKM)的中值表达水平。

21.权利要求1-18任一项的组合物，其中至少一个所述突变MHC-结合表位在受试者肿瘤中具有高于10标准化含突变阅读片段计数(NMRC)的表达水平。

22.权利要求1-18任一项的组合物，其中每个所述突变MHC-结合表位在受试者的肿瘤中具有高于50NMRC的表达水平。

23.前述任一项权利要求的组合物，其中至少一种所述抗原肽在施用所述抗原肽的受试者中刺激对表达所述一个或多个突变MHC-结合表位的肿瘤细胞的T-细胞应答。

24.前述任一项权利要求的组合物，其中每种所述抗原肽在施用所述抗原肽的受试者中刺激对表达所述一个或多个突变MHC-结合表位的肿瘤细胞的T-细胞应答。