[发明专利]在数字病理学中的信息转换

说明书

本发明涉及一种在样品载玻片（14）处的注释（22）的图示。本发明的意图是将在参考载玻片（12）处提供的注释（22）拷贝到样品载玻片（14）。典型地，特别是通过扫描参考载玻片（12）而提供参考载玻片（12）的参考图像（26）。参考图像（26）因此具有关于由参考载玻片（12）承载的参考切片（16）的信息。另外，参考载玻片（12）已被标记有感兴趣区域（20）和注释（22），该注释可以与感兴趣区域（20）关联。如果这种参考载玻片（12）被扫描，各个参考图像（26）也包含关于所标记感兴趣区域（20）以及注释（22）的信息。另外，承载样品切片（18）的样品载玻片（14）可以被扫描，以便提供样品图像（28）。样品切片（18）和参考切片（16）切割自从生物材料的同一对象（10）。特别地，紧接着在材料块的切割已被进行以提供参考切片（18）之后，样品切片（16）被切割。由于参考切片（16）和样品切片（18）来自同一对象（10），它们的特征是非常可能使得参考图像（26）和样品图像（28）非常相似。由于此相似性，参考载玻片（12）的注释（22）基于在参考图像（26）和样品图像（28）之间的图像辨别而被拷贝到样品载玻片（14）。

技术领域

本发明涉及数字病理学，并且特别地涉及在承载生物材料的切片的载玻片之间的注释的转换。

背景技术

病理学家在治疗周期的诊断部分中具有核心作用。当生物材料样品在活检期间从病人取得时，通常是病理学家通过对来自活检的组织和细胞的显微检查而作出关于潜在疾病的性质和严重性作出最终诊断。

在一示例中，用于显微检查的载玻片可以在下述的若干步骤中被制备。首先，生物材料样品可以安放在福尔马林中用于固定并且随后被处理到石蜡块中，从该石蜡块切割得到薄的约5μm的切片。这些切片的一个然后安放在载玻片的基底上，特别地安放在玻璃基底上，此后一个或者多个染色物质可以被应用，使得相关的细胞或者组织部分利用显微镜是可见的。之后，匹配的液体和/或固定剂可以添加至切片。另外，薄的（约170μm）、透明的盖玻片可以被安放到切片的顶部，使得该切片被密封。这使包括该切片的该载玻片的长期存储（特别地多于10年）成为可能。

尽管病理学典型地是模拟的职业，近期已经存在朝向数字病理学的移动，以便改善诊断效率和质量。数字病理学指的是用于在生物学、组织学和/或病理学的领域中分析生物材料（特别是切片）的所需要信息的数字化。特别地，数字病理学指的是先前已经从生物材料样品切割的切片的数字分子诊断。

数字病理学的示例性适配将导致病理学家本身不再物理地处理该载玻片，而是利用数字图像工作，数字图像可以从载玻片和其他临床信息取得以用于做出他或者她的诊断。

使用合适的分切技术（例如，通过激光的微分切），一个或者若干个小组织样品可以从由载玻片的基底承载的切片切割得到。小组织样品可以经历另外分子测试，诸如DNA基因分型或者RNA转录成型。典型地，病理学家在切片选择一个或者若干个感兴趣区域，该切片可以经历先前解释的分切技术。经常，这个选择通过在载玻片的背侧上做标记而作出。操作者可以然后使用聚焦激光束用于沿着该标记的线而切割，其将感兴趣区域和周围组织样品区域分开。所分开的组织样品然后被提取用于经历另外分子诊断。

US2012/0045790A1涉及一种微型分切方法和一种信息处理系统。为了方便在生物材料样品中选择感兴趣区域以及在该感兴趣区域提取组织样品的步骤，基于数字图像中的感兴趣区域而确定样品切片中的感兴趣区域被提供，其中样品组织在各个感兴趣区域从该样品切片被提取。