[发明专利]用于下一代测序的高分子量DNA样品追踪标签

权利要求书

1.一种合成的核酸标签，其核酸序列包含结构A-B-C的多个重复单元，所述合成的核酸标签具有由下式表示的总体结构：

X_i-[A-B-C]_n-Y_j，

其中，所述合成的核酸标签包括n个重复的所述结构A-B-C

其中，n为至少2，

其中，A、B和C中的每一个是具有至少两个核苷酸残基的限定长度的核酸，

其中，所述合成的核酸标签包含i个重复的X，

其中，所述合成的核酸标签包括j个重复的Y，

其中，X是上述C、除上述C外的另一种核酸和对标签末端进行的核酸修饰中的至少一个，

其中，Y是上述A、除上述A外的另一种核酸和对标签末端进行的核酸修饰中的至少一个，

其中，X或Y不是B,

并且其中i和j是独立地选自0-100的整数，

至少B具有不与在用于分析的样品中发现的任何序列杂交的序列，并且参考序列分析程序BLASTN所测定的，B与样品中的任一序列有低于10％的同一性，

其中，B具有足够的长度以确保不同标签中个体B元件之间至少为2的莱文斯坦距离，

所述标签的长度大于2千碱基。

2.如权利要求1所述的标签，其中：

A和C中的每一个包含至少一个引物着陆点序列元件，在所述引物着陆点序列元件中与其杂交的引物可以被延伸，并且

另外其中，A和C具有彼此相容的核苷酸序列，在所述核苷酸序列中相反方向的引物可以同时与A和C两者杂交，从而通过延伸所杂交的引物产生扩增产物。

3.一组用于序列分析的样品，其中，每个样品含有至少一种根据权利要求1所述的合成的核酸标签，

其中，A和C各自为长度至少8个核酸，并且其中A和C为相同长度和不同长度之一；并且

其中，B包含至少8个核酸。

4.如权利要求1所述的标签，其中，所述标签的至少一部分是双链的。

5.如权利要求1的标签，其中，所述标签包含至少一个甲基化的核苷酸。

6.如权利要求1的标签，其中，所述标签包含至少一个结合部分。

7.如权利要求1所述的标签，其中，所述标签包含用于RNA聚合酶的至少一个启动子序列。

8.如权利要求1所述的标签，其中，所述标签是设置在收集容器、以及被吸附到收集工具表面上中的一种。

9.一种包含如权利要求1所述的标签的试剂盒。

10.如权利要求9所述的试剂盒，其中：

所述试剂盒中的不同标签在结构上彼此相关，其中：

每种标签具有相同的A序列元件；

每种标签具有相同的C序列元件；并且

每种标签具有B序列元件，所述B序列元件与所述试剂盒中其他标签中的每一种的B序列元件不同。

11.如权利要求9所述的试剂盒，还包括样品收集管。

12.如权利要求9所述的试剂盒，其中，所述多种核酸分子标签的至少一部分包含至少一个甲基化的核苷酸。

13.如权利要求9所述的试剂盒，其中，所述多种核酸分子标签的至少一部分包含至少一个结合部分。

14.如权利要求13所述的试剂盒，其中，所述结合部分是生物素。

15.如权利要求9所述的试剂盒，其中，所述多种核酸分子标签的至少一部分包含用于RNA聚合酶的至少一个启动子序列。