[发明专利]黄瓜中紧凑生长的标记

说明书

本发明涉及用于鉴定显示紧凑生长表型的黄瓜植物的标记，所述紧凑生长表型的特征在于较短的节间长度和/或较小的叶面积。所述标记在Cullin1基因中包含突变，从而提供与不具有Cullin1基因内的所述突变的黄瓜植物相比具有较短的节间长度和/或较小的叶面积的黄瓜植物。显示所得的紧凑生长表型的植物特别适用于高线材栽培。此外，本发明还涉及经修饰的黄瓜Cullin1基因或其部分用于鉴定显示较短的节间长度和/或较小的叶面积的黄瓜植物的用途。

本发明涉及用于鉴定适于高线材栽培(high-wire cultivation)的植物的标记以及该标记的用途。

在高线材黄瓜栽培中，使用较高的种植密度来获得较高的每平方米产量。另外，高线材栽培可使植物生产黄瓜果实的栽培期更长。然而，并不是所有的品种都适合这种类型的栽培。本发明的目标是提供用于鉴定这种植物的手段。

在WO2009/059777中描述了适于高线材栽培的黄瓜植物。与通常类型的长黄瓜相比，所公开的黄瓜植物表现较短的节间、较短的侧枝、较小和较深色的叶片，其保持绿色的时间更长，具有较平整的叶片，较小的花朵，更多的叶片水平取向，较短的果实，以及最重要地较慢的生长速度。这些特征是由称为“紧凑基因”(compact gene)的未知遗传决定子引起的。据描述，紧凑基因的遗传基因座可借助后代中的侧翼AFLP标记来证明和监测，所述后代通过将包含该遗传基因座的黄瓜植物与不包含该遗传基因座的短黄瓜类型或小黄瓜类型植物杂交获得，并且可通过杂交将所述遗传基因座引入至可与根据本发明的黄瓜植物杂交的每一植物中。

然而，本申请中公开的AFLP标记在长型黄瓜类型中不是多态性的，因此选择包含所述紧凑基因的长黄瓜类型包括首先将这种植物与短黄瓜或小黄瓜(两者都缺乏紧凑基因)杂交，并用与所述紧凑基因座连锁的一个或多个所述公开的AFLP标记分析这种杂交的后代(例如，F1代和/或F2代)。

因此，WO2009/059777中公开的AFLP标记不便于使用，并且其中描述的方法非常费力且效率低下。此外，使用AFLP标记作为鉴定和监测工具的用途已经过时，因为近十年来，测序工具变得越来越成熟并且成本更低。这使得难以(如果不是不可能的话)找到可以进行AFLP分析的服务公司或组织。

考虑到如此处描述的障碍和问题，需要监测所述紧凑基因表型(适合用于高线材栽培的表型)背后的遗传决定子的方便而有效的方法。

在导致本发明的研究中，发现紧凑表型或适于高线材栽培的表型是由Cullin1基因中的突变引起的。具有所述突变基因的植物特别适合于高线材栽培。这样的植物显示较短的节间长度和/或较小的叶面积，并且还可显示如本文描述为紧凑生长表型的其它特征。发现黄瓜Cullin1基因中的突变是SEQ ID NO：1的位置147处(即编码序列(CDS)的ATG起始密码子的下游)的特异性取代，并且包含从腺嘌呤到鸟嘌呤的变化。

图1显示野生型黄瓜Cullin1核苷酸序列SEQ ID NO：1。图2显示突变型黄瓜Cullin1核苷酸序列SEQ ID NO：2。

该突变是所谓的单核苷酸多态性(SNP)。该SNP是基因组序列中的单核苷酸，所述单核苷酸在显示正常表型并在SEQ ID NO：1的位置147处具有腺嘌呤(A)的黄瓜植物与包含所述紧凑生长表型并在SEQ ID NO：2的位置147处具有鸟嘌呤(G)的黄瓜植物之间不同(A/G)。

因此，本发明涉及用于鉴定显示紧凑生长表型的黄瓜植物的标记，所述标记在SEQID NO：1的序列的位置147处包含SNP，其中所述SNP包含从腺嘌呤至鸟嘌呤的变化。

在一个实施方案中，所述标记包含SEQ ID NO：2的序列或其部分，所述部分包含所述SNP。

在一个实施方案中，所述紧凑生长表型包含较短的节间长度和/或较小的叶面积。

如本文中所用，术语“较短的节间长度”和“较小的叶面积”定义如下。