[发明专利]新颖微生物及其在农业中的用途

说明书

一种重氮营养葡糖醋杆菌(Gd)菌株，该菌株的特征在于选自SEQ ID NO 1‑10的至少一种核酸序列或其变体或旁系同源物的存在和/或大小约17566bp的单个质粒的存在。这样的菌株，由IMI504853所示例的，可用于农业，特别地因为它们能够在细胞内定殖植物。

技术领域

本发明涉及新颖微生物(特别是固氮细菌重氮营养葡糖醋杆菌(Gd)的新颖菌株)及其在农业中的用途，包括含有这些微生物的农业上可接受的组合物。就这些菌株在细胞内定殖植物细胞的能力而言，这些菌株在农业上具有良好的效用，产生了特别有效的固氮作用。用于鉴定和监测这些菌株的用途的试剂盒形成了共同未决申请的主题。

背景技术

已经对重氮营养葡糖醋杆菌(Gd)的其固氮作用和植物生长促进活性进行了充分研究，如Eskin等人，International Journal of Agronomy[国际农学杂志](2014):1-13所综述。然而，Gd的某些菌株已显示出在植物的处理中是特别有利的，因为它们能够在植物细胞内在细胞内建立，同时表现出物种和组织独立性(Cocking等人，In vitro Cellular&Developmental Biology Plant[体外细胞与发育生物学植物](2006)42(1))。这些特性，与其在整个植物组织范围行进的能力相结合，使得这些菌株能够更好地向靶标作物植物递送好处。

然而，存在广泛的Gd菌株，并且尚不可能提供用于容易地鉴定具有这些有益特性的菌株的装置。

此外，生物肥料的一个重要方面是以自然友好的方式向农作物植物提供化肥的替代品。然而，它将有助于在大田条件下验证任何正在进行的处理的有效性，使得农民能够确定需要提供什么水平的氮肥(若有的话)来增强生长条件。

申请人已经发现Gd的特定优势菌株含有在其他Gd物种中没有发现也没有在任何其他物种(包括植物物种)中发现的许多独特核酸序列。这意味着可以很容易地鉴定出有益的菌株并导致提供可靠的诊断测试，用于监测大田里和研究中的处理，用于鉴定相关的有益菌株。

发明内容

根据本发明，提供了一种重氮营养葡糖醋杆菌(Gd)菌株，该菌株的特征在于选自SEQ ID NO 1-10的至少一种核酸序列或其变体或旁系同源物的存在和/或大小约17566bp的单个质粒的存在。

已经发现具有这些独特特征的菌株在植物细胞的细胞内定殖方面特别有效，导致有利的固氮作用。具体而言，已经发现使用本发明的菌株导致作物(如谷类作物，像玉蜀黍和小麦)的产量增加。可替代地，在甚至减少传统的氮肥施用的情况下，也可以获得相似的产量。

下文的SEQ ID NO 1-10的序列(在附表1中显示)存在于特定菌株IMI504853中，但不出现在其他可用菌株的基因组分析中。

SEQ ID NO 1-10的变体将包括高度天然存在的变体的等位基因形式。它们将与基本序列具有高水平的序列同一性，例如至少70％，例如至少71％、75％、79％、81％、84％、87％、90％、93％、95％、96％或98％同一性。在该上下文中的同一性可以用SEQ ID NO 2或片段(特别是如下所描述的片段)作为基本序列使用BLASTP计算机程序来确定。在以下网站可公开获得BLAST软件：http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi(于2015年7月27日访问)。

然而特别地，本发明的菌株的特征在于SEQ ID NO 1-10的至少一种核酸，合适地SEQ ID NO 1-10的至少3种不同的核酸序列，例如SEQ ID NO 1-10的至少5种或至少8种不同的核酸序列的存在，并且特别地特征在于SEQ ID NO1-10的所有核酸序列的存在。