[发明专利]用于快速检测沙门氏菌血清变种D1的组合物和方法

说明书

本发明特征在于用于检测沙门氏菌(例如，在食品，环境样品，生物样品或其他材料中)的快速和准确的方法。

相关申请的交叉引用

本申请要求2015年7月20日提交的美国专利临时申请62/194,640号的优先权。本申请的全部内容通过引用纳入本文。

背景技术

沙门氏菌是全世界食物携带疾病最常见的病原体之一。它引起人类和动物的大量感染。事实上，每年沙门氏菌导致全世界约9380万人感染和155,000人死亡。沙门氏菌感染与食用受动物或人粪便污染的食物，例如肉、蛋和新鲜农产品(produce)等有关。沙门氏菌病的主要原因是禽类和蛋。认识到防止沙门氏菌传播的重要性，2014年美国FDA敦促美国科学家开发改进的沙门氏菌检测方法。目前用于检测食品中沙门氏菌的方法困难，昂贵和耗时。迫切需要快速准确的检测方法，以防止受沙门氏菌污染的食品进入动物或人类食物链。

发明内容

如下所述，本发明特征在于用于检测沙门氏菌(例如，在食品，环境样品，生物样品或其他材料中)的快速和准确的方法。

在一个方面，本发明的特征在于检测样品中的沙门氏菌的方法。该方法涉及使样品在存在切口酶，dNTP，可检测探针和聚合酶的情况下与正向和反向引物接触，所述正向和反向引物在允许核酸分子等温扩增的条件下与沙门氏菌核酸分子特异性结合，和检测样品中沙门氏菌的扩增子，其中所述方法检测以下靶序列：

5’–TATTGCAGGTAAAGGGGCTTCGGTATCTGGTGGTGTAGCCACTGT-3’。

在另一个方面，本发明的特征在于用于检测样品中的沙门氏菌的方法。该方法涉及在存在Nt.BstNBI(NEB公司)切口酶，dNTP，Bst DNA聚合酶I和具有以下序列的可检测探针的情况下：

5’CGCTCCACCAGATACCGAAGCG 3’，将样品与分别具有以下序列的正向和反向引物接触：

5’GACTCGATATCGAGTCTATCTATTGCAGGTAmAmAmGmGmG 3’

5’GACTCGATATCGAGTCCGGGACAGTGGCTmAmCmAmCmC 3’；和

检测是否存在沙门氏菌扩增子，其中沙门氏菌扩增子的存在鉴定样品中的沙门氏菌。

在另一方面，本发明的特征在于引物，其选自以下正向引物

5’-GACTCGATATCGAGTCATCTATTGCAGGTAAmAmGmGmGmG-3’

5’-GACTCGATATCGAGTCATCTATTGCAGGTAmAmAmGmGmG-3’

5’-GACTCGATATCGAGTCTATCTATTGCAGGTAmAmAmGmGmG-3’

5’-GACTCGATATCGAGTCGTATCTATTGCAGGTmAmAmGmGmG-3’

5’-GACTCGATATCGAGTCAGTATCTATTGCAGGTmAmAmAmGmG-3’

5’-GACTCGATATCGAGTCGTATCTATTGCAGGTAmAmAmGmGmG-3’

和反向引物：

5’-GACTCGATATCGAGTCGGACAGTGGCTACAmCmCmAmCmC-3’

5’-GACTCGATATCGAGTCGGGACAGTGGCTACAmCmCmAmCmC-3’

5’-GACTCGATATCGAGTCCGGGACAGTGGCTACmAmCmCmAmC-3’