[发明专利]烟草花叶病毒的新物种

说明书

本发明提供了烟草花叶病毒的新物种，以及其用于鉴定包含针对该病毒的抗性的植物的用途。

技术领域

本发明涉及烟草花叶病毒属(tobamovirus)(帚状病毒科(Virgaviridae))的新物种，其感染茄科(Solanaceae)植物。本发明还涉及所述病毒物种用于鉴定和/或产生抗性茄科植物(例如番茄、烟草、辣椒和茄子)的用途。所述新的烟草花叶病毒物种能够在携带番茄花叶病毒(ToMV)抗性基因Tm1、Tm2和Tm2²的番茄植物上繁殖和扩散，即这些抗性基因针对所述新病毒是无效的，并且植物被感染时产生多种症状，例如叶的(温和)花叶病、叶赤褐化、起疱和叶变形。提供了一种新的病毒物种——其在本文中称为番茄花叶重型病毒(ToMSV或TMSV)，用于诊断所述新烟草花叶病毒物种在茄科物种(特别是番茄、烟草、辣椒和茄子)的植物和/或植物部分中的存在的方法，以及使用所述新病毒的分离株(例如分离株VE484(2015年1月19日以登录号DSM 29970保藏))来筛选具有针对所述病毒的抗性的植物和/或植物部分的方法。

背景技术

历史上，番茄中的烟草花叶病毒被共同归类为烟草花叶病毒(TMV)毒株。然而，现在根据序列的不同将这些烟草花叶病毒分类为不同的病毒物种。烟草花叶病毒物种包括辣椒温和斑点病毒(PMMV)、烟草花叶病毒(TMV)、番茄花叶病毒(ToMV)和许多其他的病毒(参见例如病毒的ICTVdB索引(ICTVdB Index of Viruses))。

植物病毒可对水果和蔬菜的生产具有破坏性。尽管许多商业品种携带病毒抗性基因，这样的抗性基因可变得无效，因为物种的抗性破坏毒株可进化或新病毒物种可进化。在番茄中，三种显性ToMV抗性基因几十年来被用于防治ToMV，即Tm1(从多毛番茄(S.habrochaites)基因渗入；赋予针对ToMV毒株0和2的抗性)、Tm2和Tm2²(都从秘鲁番茄(S.peruvianum)基因渗入，分别赋予针对ToMV毒株0和1以及0、1和2的抗性)。Tm1抗性基因编码的蛋白结合ToMV复制蛋白并抑制ToMV的RNA依赖性的RNA复制。ToMV的抗性破坏突变体的复制蛋白不结合Tm1，表明所述结合对于抑制而言是重要的(参见Ishibashi和Ishikawa,J Virol.2013年7月；87(14):7933-7939)。Tm2²抗性基因编码识别ToMV移动蛋白(特别是所述移动蛋白的羧基末端)的蛋白，并且在所述移动蛋白的羧基末端具有氨基酸变化的Tm2²抗性破坏毒株不再被识别，从而能够克服抗性(参见Weber和Pfitzner,1998,MPMI 11卷,498-503页)。在抗性基因和病毒进化之间存在着持续的进化竞赛。因此，快速鉴定新病毒是重要的，以获得用于鉴定有效针对这类新病毒的抗性基因的工具。

本发明的一个目的是鉴定烟草花叶病毒的新物种，其在本文中被称为番茄花叶重型病毒(ToMSV或TMSV)，其能够感染携带这三种抗性基因的任一种或其组合的番茄植物。本发明的另一个目的是提供用于诊断这种新病毒物种的方法，以及使用所述物种的毒力分离株来筛选种质中的新抗性源的方法。

发明内容

本文使用的术语“包括”及其变化形式以其非限制性含义使用，意指包括该词之后的项，但是不排除未特别提及的项。然而，技术人员将理解，术语“包括”还涵盖了术语“由……组成”。此外，通过叙述“一”或“一个”来提及要素不排除多于一个该要素存在的可能性，除非上下文清楚地需要有且仅有一个该要素。因此，“一”或“一个”通常意指“至少一个”或“一个或多个”。