[发明专利]用于提高的乳产量的育种母牛的方法

说明书

本申请人已经鉴定出三种关键的表型/遗传测量与过渡期健康高度相关，并且可用于选择和育种方案和/或与传统育种和标记辅助选择方法组合以提高过渡期健康的可预测性。根据本发明，已经发现对乳房炎、酮病和子宫炎的遗传评定高度预测整体过渡健康。通过直接测量数以千计的特定动物的祖先中乳房炎、酮病和子宫炎的临床病例，并在选择中使用这些数据，来产生遗传评定。本申请人的选择标准以及通过减少初始群体和后代中的过渡母牛疾病发病率来快速影响育种者群体。

相关申请的交叉引用

本申请根据35U.S.C.§119要求于2015年7月29日提交的美国临时专利申请第62/198,455号和2016年6月16日提交的第62/350,813号的优先权，其全部内容通过引用并入本说明书中。

发明领域

本发明涉及选择和育种方法，以及所得的具有提高的乳生产性状(包括乳产量和乳成分，以及过渡到泌乳)的牛后代和群体。

发明背景

全球每个乳制品生产商都面临着每个进入挤奶线(milking string)的雌性从怀孕过渡到产犊并最终有效地生产足够的乳来创造利润的挑战。在一年中，由于健康问题，农民在产犊后的两个月内可能失去高达10％的畜群。事实上，乳牛中75％的疾病发生在泌乳开始后的头60天，多达50％的高产母牛受到影响。增加确保母牛健康过渡的重要性，是治疗过渡期疾病的经济承诺。对于每种疾病发病率，每次泌乳每次疾病情况的成本在$200到$400之间。在有1000头母牛以及平均疾病发病率为15％的乳畜群中，单是由于子宫炎的年度总经济损失可能高达$53,000，表明这是重大的经济负担。

过渡期是关键的，因为怀孕母牛身体的首要和优先考虑最重要的是制造乳，即使是以她自己的健康为代价。她将使用她自己的能量储备，导致负的能量平衡，这会对她的短期和长期健康产生负面影响。这由于怀孕导致母牛的免疫系统抑制而恶化。由于这种行为，并与传统的逻辑相反，低乳生产不一定是母牛在该期间已经发展有健康问题或者容易受到健康问题的影响的指示，因为过渡不好的母牛仍然是优质的乳生产者。

农民已经尽全力利用可得的工具预防和应对过渡母牛时期期间出现的健康问题。随着新的管理、动物健康和营养工具的引入，农民们急切地对其进行投资，希望在每头母牛的生命中最小化与该过渡期相关的健康问题的负面影响。不幸的是，收获通常是暂时的，且农民在每次母牛经历该期间时都必须重新投资这些工具。因此，对于育种者，本领域仍然需要有效地将对额外的预防性和反应性措施的需求最小化，同时减少母牛在过渡期期间容易受到影响的负面健康问题。根据本发明，育种者现在可以改变他们的方法，并且开始为他们的畜群选择被证明为有效地将对额外的针对过渡母牛健康问题(例如乳房炎、子宫炎和酮病)的预防性和反应性措施的需求最小化的遗传学。遗传选择是对畜群进行永久性改变的一种累积性和有成本效率的方式，从而不必依赖目前使用的预防和治疗的周期。

传统的育种技术涉及种畜后代的研究，并评定其乳生产等级(育种值或遗传优势(genetic merit))，以指导进一步的育种。这项标准技术需要数年通过后代测试每头公牛来评定真实遗传值。许多母牛必须繁殖并生下子代。雌性必须被养育、繁殖、分娩且最后进行一段时间挤奶，以测量其表型性状。

此外，纯粹基于表型特征的选择不能有效地将由复杂基因作用和相互作用引起的遗传变异性以及环境和发育变量的影响考虑进来。因此，需要一种遗传评定牛的方法，使得育种者更精确地选择表现出理想表型和遗传性状的动物。

基因组选择可以降低目前用于改良种畜的后代测试的高成本，因为年轻的公牛后代可以在出生后立即或者甚至在出生之前对其进行评定，并且对于标记的存在/不存在，通过遗传测试确定的具有不理想标记的年轻公牛将永远不会进行后代测试。传统想法是全基因组标记是动物整体健康和状态的最佳预测。位于基因组的不同区域例如不同染色体的多个基因座可包括至少100个、或至少500个、或至少1000个、或至少5000个或更多不同的基因座。