[发明专利]核酸序列信息的空间定位

权利要求书

1.用于空间检测和分析组织样品中的核酸的捕捉阵列，其包含多个捕捉位点，其中每个捕捉位点包含相同捕捉位点内表面上不同位置处固定化的探针对，其中所述探针对的第一探针包含第一引物结合区序列和独特的空间地址区序列且不包含捕捉区序列，其中所述空间地址区序列包含对每个捕捉位点独特的核酸序列以使所述多个捕捉位点的每个捕捉位点的空间地址区序列相对于彼此不同，其中所述探针对的第二探针包含第二引物结合区序列和捕捉区序列且不包含空间地址区序列，其中所述第二探针在所述捕捉位点的每一个处都是相同的序列，其中

所述捕捉区序列包含多聚T捕捉序列，并且所述多聚T捕捉序列被配置为与包含多聚A尾的靶核酸杂交，

其中所述捕捉区序列可延伸以形成固定化的第一互补链，所述固定化的第一互补链随后可以与所述探针对的第一探针的空间地址区序列连接以在两个末端固定化所述第一互补链。

2.权利要求1的捕捉阵列，其中捕捉位点中的所述探针对是多个探针对。

3.权利要求2的捕捉阵列，其中所述捕捉阵列的一个或多个捕捉位点具有相同数目的所述第一探针和所述第二探针。

4.权利要求1的捕捉阵列，其中所述捕捉阵列整合到电泳系统中。

5.权利要求4的捕捉阵列，其中整合到所述电泳系统中的所述捕捉阵列的所述捕捉位点配置用于转移并且捕捉来自组织样品的核酸，使得来自所述组织样品的核酸的扩散和捕捉位点间的核酸损失相对于其它方面相同的条件下通过被动扩散发生的被动核酸转移得以实质性降低。

6.用于空间检测和分析组织样品中的核酸的方法，其中所述方法不用于诊断应用，所述方法包括(a)提供权利要求1-5中任一项的捕捉阵列，(b)使所述多个捕捉位点与组织样品接触，使得所述阵列上每个捕捉位点的位置可以与所述组织样品中的位置相关联；(c)所述组织样品的核酸与所述多个捕捉位点的探针对的第二探针的多聚T捕捉序列杂交以形成杂交的第二探针；(d)延伸所述杂交的第二探针的所述捕捉区序列以形成靶核酸的固定化的第一互补链；和(e)在每个捕捉位点，将所述固定化第一互补链与所述探针对的第一探针的空间地址区序列连接以在两个末端固定化所述第一互补链。

7.权利要求6的方法，其还包括(f)使用与所述第一探针的所述第一引物结合区序列互补的引物来合成第二互补链；(g)从所述捕捉阵列的表面释放所述第二互补链；(h)分析释放的第二互补链的序列，并且(i)将所述释放的第二互补链的序列与所述组织样品中的所述核酸的位置相关联。

8.权利要求7的方法，其中所述组织样品的核酸与所述第二探针的所述多聚T捕捉区序列杂交包括将所述核酸从所述组织样品电泳转移到所述捕捉阵列上。

9.权利要求6的方法，其中所述第一引物结合区序列和所述第二引物结合区序列是不同的。

10.权利要求2的捕捉阵列，其中所述捕捉阵列的一个或多个捕捉位点具有比第二探针多的第一探针。

11.权利要求2的捕捉阵列，其中所述捕捉阵列的一个或多个捕捉位点具有比第一探针多的第二探针。