[发明专利]用于性状渐渗的方法和系统在审
| 申请号： | 201680057770.7 | 申请日： | 2016-10-25 |
| 公开（公告）号： | CN108135144A | 公开（公告）日： | 2018-06-08 |
| 发明（设计）人： | C·奥克森费尔德;T·曼斯菲尔德;C·埃文斯;J·易;P·马里;J·C·唐;J·L·汉密尔顿;J·迈耶;S·伦斯利;J·W·宾;R·奥斯汀 | 申请（专利权）人： | 美国陶氏益农公司 |
| 主分类号： | A01H5/10 | 分类号： | A01H5/10;A01H1/06;G06F19/22;G06F19/12 |
| 代理公司： | 北京坤瑞律师事务所 11494 | 代理人： | 罗天乐 |
| 地址： | 美国印*** | 国省代码： | 美国;US |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 性状 系统提供 研究管理 用户计算 用户友好 基因型 自交系 推演 度量 省时 转化 预测 统计 表现 分析 | ||
1.一种用于性状渐渗的计算机化方法，包括：
(a)通过收集植物中的全基因组遗传标记信息来生成遗传标记数据库；
(b)从至少一个回交植物样本获得序列；
(c)将步骤(b)中获得的所述序列与步骤(a)的所述遗传标记数据库进行比较以推演遗传标记；以及
(d)预测所述回交植物样本是劣种植物还是非劣种植物。
2.根据权利要求1所述的方法，还包括以下步骤：选择预定数量的具有用于杂交的最有利遗传谱的植物。
3.根据权利要求2所述的方法，其中所述预定数量在5与50之间。
4.根据权利要求1所述的方法，其中所述遗传标记包括单核苷酸多态性(SNP)。
5.根据权利要求1所述的方法，其中所述遗传标记数据库是SNP数据库或SNP文库。
6.根据权利要求5所述的方法，其中所述SNP数据库或SNP文库包含具有100与500个之间的SNP的全基因组SNP集合。
7.根据权利要求5所述的方法，其中所述SNP数据库或SNP文库包含至少1,000个SNP的全基因组SNP集合。
8.根据权利要求5所述的方法，其中所述SNP数据库或SNP文库包含具有1,000与100,000个之间的SNP的全基因组SNP集合。
9.根据权利要求1所述的方法，其中所述植物选自大豆、玉蜀黍、卡诺拉油菜、棉花、小麦、向日葵和稻谷。
10.根据权利要求1所述的方法，其中所述回交植物样本来自第一代、第二代、第三代、第四代、第五代回交植物或其组合。
11.根据权利要求5所述的方法，其中步骤(c)的所述比较步骤使用基因型推演模块。
12.根据权利要求1所述的方法，其中步骤(d)的所述预测步骤使用标记研究管理器模块。
13.根据权利要求12所述的方法，其中所述标记研究管理器模块提供用于预测/评估非劣种植物和劣种植物的数量的可视化输出。
14.一种用于性状渐渗的计算机化系统，包括：
(a)遗传标记数据库；
(b)遗传标记推演模块，其接受来自至少一个回交植物样本的序列的输入；和
(c)标记研究管理器模块，其提供可视化输出。
15.根据权利要求14所述的系统，其中所述标记研究管理器模块提供用于预测/评估非劣种植物和劣种植物的数量的可视化输出。
16.根据权利要求14所述的系统，其中所述标记研究管理器模块提供用于选择预定数量的具有用于杂交的最有利遗传谱的植物的可视化输出。
17.根据权利要求16所述的系统，其中所述预定数量在5与50之间。
18.根据权利要求14所述的系统，其中所述遗传标记数据库是SNP数据库或SNP文库。
19.根据权利要求18所述的系统，其中所述SNP数据库或SNP文库包含具有100与500个之间的SNP的全基因组SNP集合。
20.根据权利要求18所述的系统，其中所述SNP数据库或SNP文库包含至少1,000个SNP的全基因组SNP集合。
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