[发明专利]用于细胞检测的试剂盒

说明书

一种设备包括壳体和致动器。壳体可以可移除地联接到反应室，壳体限定可以接收试剂容器的试剂体积。当壳体联接到反应室时，壳体的输送部分限定试剂体积与反应室之间的输送路径。输送路径包括突出部，使得输送路径具有不连续的内表面。可以移动致动器，以将试剂从试剂容器经由输送路径传送到反应室中。

技术领域

本文中所描述的实施例涉及用于使用改造的转导颗粒进行细胞检测的系统和方法。更具体地，本文中所描述的实施例还涉及容器和仪器，在其内可以在集成的、封闭的系统中利用简易（walkaway）功能执行对细菌的检测。

背景技术

细菌（尤其是耐药菌株）的检测是在诊断细菌感染和限制细菌感染的传播中的重要步骤。例如，MRSA是在美国由很大一部分人口携带的常见金黄色葡萄球菌的耐药变体。MRSA的大部分感染发生在医院中，且会具有高的死亡率（来自2010的数据表明，在美国每年大约19,000人死于MRSA感染）。因此，存在对导致感染的细菌菌株（包括其表型和/或基因型以及其他分子目标），诸如MRSA，进行有效、准确且快速识别的需要。特别重要的是能够从多种不同的样本（例如，人类样本、环境样本、植物样本、兽医样本、食物样本等等）中识别细菌表型和/或基因型和其他分子目标，使得可以以及时的方式开始适当的治疗和控制方案。

用于识别细菌的一个已知方法包括细菌培养。培养是高度敏感的，但是常常需要18个小时或更长时间才能产生结果，且因此不适于快速诊断或用于有效筛选目的。已知的培养方法常常使用要求受过高级培训的人员来执行化验的系统来执行，并且因此不适于在多种不同的设定中使用。已知的培养方法还易于受到污染，这可能导致假阳性和/或细菌的错误识别。此外，已知的培养方法针对各种菌种的识别采用专门定制的培养方案，因此测试广泛的细菌实验对象（panel）会迅速提高成本。

直接细菌免疫检测（即，使用抗体抗原反应的检测）是用于细菌检测的另一种方法。已知的免疫检测方法相比培养可以更快速且以更低成本产生结果，但是常常受限于用于所感兴趣的细菌菌株的选择性抗体的可用性，且可用的抗体易于发生交叉反应。这些已知的方法相比培养还更不敏感，因此常常仍然存在细菌扩增的需要，这会延长化验时间。

用于检测细菌细胞的其他已知方法包括提取和分析诸如DNA或RNA的核酸。用于从样本提取核酸的已知方法常常包括若干严格的样本制备步骤，其需要昂贵且专门的装备。具体地，这样的步骤包括1）通过添加蛋白酶移除在包含细菌或细胞的样本内的蛋白质；2）分解剩余的总样本（bulk sample）以暴露包含在其内的核酸（也称为细胞裂解）；3）从样本沉淀核酸；4）洗涤和/或以其他方式制备核酸以供进一步分析；5）分析核酸以识别物种。在制备样本之后，已知分析方法可以包括聚合酶链反应（PCR）、基因序列测定、基因指纹图谱、荧光、免疫测定、电化学免疫测定、基因芯片、任何其他合适的技术或其组合。已经发现PCR的广泛商业用途，但是常常需要涉及昂贵试剂和测试设备的多个步骤。涉及PCR的许多已知方法不适于台式（bench top）测试（例如，其要求相对熟练的人员）。此外，已知PCR方法采用热循环和/或升高的温度，这会增加分析的成本、时间和/或复杂度。另外，因为基于核酸扩增的技术不测量细菌对于抗生素的反应，所以这样的技术不适于抗生素敏感性测试。最后，因为核酸扩增方法裂解样本细胞，所以这样的方法不能区分活细胞和死细胞。