[发明专利]检测癌症复发的方法

权利要求书

1.一种用于确定受试者将复发癌症的可能性的处理系统，其中所述癌症是卵巢癌或急性骨髓性白血病，所述处理系统包括微处理器、存储器、输入/输出设备，以及一个外部接口，其经由总线互连，其中，所述微处理器执行所述存储器中存储的应用软件形式的指令，以执行以下处理：

分析从受试者获得的生物样品中的核酸分子的序列，从而对于在被诱变剂识别或靶向的一个或多个基序处的突变类型的多个突变，确定这些突变的密码子上下文，从而鉴定核酸分子中多个突变密码子中的每一个的突变位置和突变类型，其中通过确定单个突变发生在相应突变密码子的三个位置中的哪个位置来确定单个突变的密码子上下文；以及

当在多个突变密码子中的三个位置之一处的突变类型的突变水平高于与癌症复发相关的预定阈值时，确定所述受试者可能复发癌症，

其中所述诱变剂选自由AID、APROBEC3B、APOBEC3G和ADAR组成的组，所述基序是癌症进展相关性标记(C-PAS)，并且所述突变类型是构成所述突变的具体的核苷酸取代，

其中在以下情况下卵巢癌被确定为可能复发：

当在核酸分子MC-1位点处的WRCGSS基序中的C至T突变水平高于预定阈值时；

当在核酸分子MC-1位点处的TCGA基序中的C至T突变水平高于预定阈值时；

当在核酸分子MC-3位点处的ATCS基序中的C至T突变水平高于预定阈值时；

当在核酸分子MC-1位点处的GCGGC基序中的C至T突变水平高于预定阈值时；

当在核酸分子MC-1位点处的CCGX基序中的C至T突变水平高于预定阈值时；

当在核酸分子MC-1位点处的ZCCG基序中的C至T突变水平高于预定阈值时；

当在核酸分子MC-1位点处的SGGRR基序中的G至A突变水平高于预定阈值时；

当在核酸分子MC-1位点处的TCCG基序中的C至T突变水平高于预定阈值时；

当在核酸分子MC-2位点处的GCGC基序中的G至A突变水平高于预定阈值时；

当在核酸分子MC-2位点处的CCGGC基序中的G至A突变水平高于预定阈值时；

当在核酸分子MC-1位点处的RAWA基序中的A至T突变水平高于预定阈值时；

当在核酸分子MC-1位点处的WTAW基序中的A至G突变水平高于预定阈值时；

当在核酸分子MC-1位点处的SARA基序中的A至G突变水平高于预定阈值时；

当在核酸分子MC-2位点处的TWTY基序中的T至C突变水平高于预定阈值时；和/或

当在核酸分子MC-3位点处的TWTY基序中的T至C突变水平高于预定阈值时；

其中在以下情况下急性骨髓性白血病被确定为可能复发：

当在核酸分子MC-1位点处的CCZ基序中的C至T突变水平高于预定阈值时；

当在核酸分子MC-2位点处的SWCS基序中的C至T突变水平高于预定阈值时；

当在核酸分子MC-3位点处的XNGNS基序中的G至A突变水平高于预定阈值时；

当在核酸分子MC-2位点处的GSA基序中的G至A突变水平高于预定阈值时；

当在核酸分子MC-1位点处的SGXW基序中的G至A突变水平高于预定阈值时；

当在核酸分子MC-3位点处的CXGS基序中的G至A突变水平高于预定阈值时；

当在核酸分子MC-3位点处的YXGNX基序中的G至A突变水平高于预定阈值时；

当在核酸分子MC-3位点处的YYGNX基序中的G至A突变水平高于预定阈值时；

当在核酸分子MC-1位点处的WNGNZ基序中的G至A突变水平高于预定阈值时。