[发明专利]用于调节潜伏的病毒转录的组合物和方法

权利要求书

1.一种用于治疗病毒感染的组合物，所述组合物包含：

核酸，所述核酸编码

多肽，所述多肽包含可编程核酸酶的非切割变体，以及

靶向性寡核苷酸，所述靶向性寡核苷酸包括与病毒基因组中的靶标互补的靶向性序列。

2.根据权利要求1所述的组合物，其中所述可编程核酸酶是Cas9并且所述靶向性寡核苷酸是向导RNA。

3.根据权利要求2所述的组合物，其中当将所述组合物引入被所述病毒感染的细胞中时：

所述多肽和所述向导RNA被表达；

所述多肽与所述向导RNA结合形成复合物；以及

所述复合物通过所述靶向性序列与所述病毒基因组中的所述靶标杂交。

4.根据权利要求3所述的组合物，其中所述复合物影响所述病毒基因组的至少一部分的转录。

5.根据权利要求4所述的组合物，其中所述复合物抑制所述病毒基因组的至少一部分的转录。

6.根据权利要求5所述的组合物，其中所述靶向性序列根据预定标准与所述靶标匹配，并且根据所述预定标准不与宿主基因组的任何部分匹配。

7.根据权利要求6所述的组合物，其中所述宿主基因组是人基因组并且所述靶向性序列根据所述预定标准不与所述人基因组的任何部分匹配。

8.根据权利要求7所述的组合物，其中所述病毒基因组中的所述靶标包括选自下组中的至少一种：乙型肝炎病毒(HBV)基因组中的preC启动子；所述HBV基因组中的S1启动子；所述HBV基因组中的S2启动子；以及所述HBV基因组中的X启动子；Epstein-Barr病毒基因组中的病毒Cp(C启动子)；卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)基因组中的次要转录启动子区；KSHV基因组中的主要转录启动子；来自单纯疱疹病毒(HSV)的Egr-1启动子；来自HSV-1的ICP4启动子；来自HSV-2的ICP 10启动子；巨细胞病毒(CMV)早期增强子元件；巨细胞病毒即刻早期启动子；HPV早期启动子；以及HPV晚期启动子。

9.根据权利要求5所述的组合物，其中所述多肽还包含转录抑制结构域。

10.根据权利要求9所述的组合物，其中所述转录抑制结构域包括选自下组中的一种：Kox1的Krüppel相关盒结构域；HP1α的染色阴影域；以及Hesl的WRPW结构域。

11.根据权利要求4所述的组合物，其中所述复合物在宿主细胞内上调转录。

12.根据权利要求1所述的组合物，其中所述病毒基因组来自选自下组的病毒：腺病毒、单纯疱疹病毒、水痘-带状疱疹病毒、Epstein-Barr病毒、人巨细胞病毒、人疱疹病毒8型、人乳头瘤病毒、BK病毒、JC病毒、天花、乙型肝炎病毒、人博卡病毒、细小病毒、B 19、人星状病毒、诺瓦克病毒、柯萨奇病毒、甲型肝炎病毒、脊髓灰质炎病毒、鼻病毒、严重急性呼吸综合征病毒、丙型肝炎病毒、黄热病病毒、登革热病毒、西尼罗病毒、风疹病毒、戊型肝炎病毒、人免疫缺陷病毒、流感病毒、关纳立特病毒、胡宁病毒、拉沙病毒、马丘坡病毒、沙比亚病毒、克里米亚-刚果出血热病毒、埃博拉病毒、马尔堡病毒、麻疹病毒、腮腺炎病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、人类间叶病毒、亨德拉病毒、尼帕病毒、狂犬病病毒、丁型肝炎病毒、轮状病毒、环状病毒、科罗拉多蜱传热症病毒和版纳病毒。

13.一种用于治疗病毒感染的组合物，所述组合物包含：

多肽，所述多肽包含Cas9酶的非切割变体，以及

靶向性寡核苷酸，所述靶向性寡核苷酸与病毒基因组中的靶标互补。