[发明专利]检测和定量微生物的靶核酸序列在审

专利信息
申请号: 201680080427.4 申请日: 2016-12-19
公开(公告)号: CN108603236A 公开(公告)日: 2018-09-28
发明(设计)人: 陈民汉;吴舒红英 申请(专利权)人: 路胜基因(新加坡)私人有限公司
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/686
代理公司: 北京世峰知识产权代理有限公司 11713 代理人: 康健;王思琪
地址: 新加坡*** 国省代码: 新加坡;SG
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摘要:
搜索关键词: 靶核酸序列 靶序列 扩增 检测 微生物 定量微生物 甲基化状态 试剂盒 无细胞 核酸 病毒
【权利要求书】:

1.一种用于检测和/或定量从受试者获得的样品中微生物的靶核酸序列的存在的方法,所述方法包括扩增所述微生物的核酸的CpG岛中的靶序列,而不论所述CpG岛的甲基化状态如何。

2.如权利要求1所述的方法,其中所述靶序列处于所述微生物的核酸的CpG岛的核酸的5'末端内。

3.如权利要求1或2所述的方法,其中所述方法是聚合酶链反应(PCR)。

4.如权利要求3所述的方法,其中所述聚合酶链反应选自由以下各项组成的组:定量聚合酶链反应、数字聚合酶链反应、实时聚合酶链反应、以及传统聚合酶链反应。

5.如权利要求1至4中任一项所述的方法,其中从所述受试者获得的所述样品是血浆样品、血清样品或全血样品。

6.如权利要求1至5中任一项所述的方法,其中从所述受试者获得的所述样品包含cfDNA(无细胞DNA)。

7.如权利要求1至6中任一项所述的方法,其中所述微生物是病毒、细菌、真菌或寄生物。

8.如权利要求7所述的方法,其中所述微生物是病毒。

9.如权利要求7所述的方法,其中所述微生物是细菌。

10.如权利要求8所述的方法,其中所述病毒是埃-巴二氏病毒(Epstein-Barrr virus)(EBV)。

11.如权利要求10所述的方法,其中所述靶序列处于EBV的BamHI-W区域的CpG岛中。

12.如权利要求11所述的方法,其中EBV的BamHI-W区域的所述CpG岛选自由以下各项组成的组:

CTCCTCTCCAACCTTCGCTCCACCCTAGACCCCAGCTTCTGGCCTCCCCGGGTCCACCAGGCCAGCCGGAGGGACCCCGGCAGCCCGGGCGAGTCGCCTTCCCTCTCCCCTGGCCTCTCCTTCCCGCCTCCCACCCGAGCCCCCTCAGCTTGCCTCCCCACCGGGTCCATCAGGCCGGCCGGAGGGACCCCGGCGGCCCGGTGTCA(SEQ ID NO.:6);

AGGCCATGCGCGCCCTGTCACCAGGCCTGCCAAAGAGCCAGATCTAAGGCCGGGAGAGGCAGCCCCAAAGCGGGTGCAGTAACAGGTAATCTCTGGTAGTGATTTGGACCCGAAATCTGACACTTTAGAGCTCTGGAGGACTTTAAAACTCTAAAAATCAAAACTTTAGAGGCGAATGGGCGCCATTTTGTCCCCACGCGCGCATAATGGCGGACCTAGGCCTAAAACCCCCAGGAAGCGGGTCTATGGTTGGCTGCGCTGCTGCTATCTTTAGAGGGGAAAAGAGGAATAAGCCCCCAGACAGGGGAGTGGGCTTGTTTGTGACTTCACCAAAGGTCAGGGCCCAAGGGGGTTCGCGTTGCTAGGCCACCTTCTCAGTCCAGCGCGTTTACGTAAGC(SEQ ID NO.:7);

CTGGTATAAAGTGGTCCTGCAGCTATTTCTGGTCGCATCAGAGCGCCAGGAGTCCACACAAATGTAAGAGGGGGTCTTCTACCTCTCCCTAGCCCTCCGCCCCCTCCAAGGACTCGGGCCCAGTTTCTAACTTTTCCCCTTCCCTCCCTCGTCTTGCCCTGCGCCCGGGGCCACCTTCATCACCGTCGCTGACTCCGCCATCCAAGCCTAGGGGAGACCGAAGTGAAGGCCCTGGACCAACCCGGCCCGGGCCCCCCGGTATCGGGCCAGAGGTAAGTGGACTTTAATTTTTTCTGCTAAGCCCAACACTCCACCACACCCAGGCACACACTACACACACCCACCCGTCTCAGGGTCCCCTCGGA(SEQ ID NO.:8);以及

CGAGGAGGCGCCCGGAGTGGGGCCGGTCGGCTGGGCTGGCCGAGCCCGGGTCTGGGAGGTCTGGGGTGGCGAGCCTGCTGTCTCAGGAGGGGCCTGGCTCCGCCGGGTGGCCCTGGGGTAAGTCTGGGAGGCAGAGGGTCGGCCTAGGCCCGGGGAAGTGGAGGGGGATCGCCCGGGTCTCTGTTGGCAGAGTCCGGGCGATCCTCTGAGACCCTCCGGGCCCGGACGGTCGCCCTCAGCCCCCCAGACAGACCCCAGGGTCTCCAGGCAGGGTCCGGCATCTTCAGGGGCAGCAGGCTCACCACCACAGGCCCCCCAGACCCGGGTCTCGGCCAGCCGAGCCGACCGGCCCCGCGCCTGGCGCCTCCTCGGGGCCAGCCGCCGGGGTTGGTTCTGCCCCTCTCTCTGTCCTTCAGAGGAACCAGGGACCTCGGGCACCCCAGAGCCCCTCGGGCCCGCCTCCAGGCGCCCTCCTGGTCTCCGCTCCCCTCTGAGCCCCGTTAAACCCAAAGAATGTCTGAGGGGAGCCACCCTCGG(SEQ ID NO.:9)。

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