[发明专利]检测和定量微生物的靶核酸序列在审
申请号: | 201680080427.4 | 申请日: | 2016-12-19 |
公开(公告)号: | CN108603236A | 公开(公告)日: | 2018-09-28 |
发明(设计)人: | 陈民汉;吴舒红英 | 申请(专利权)人: | 路胜基因(新加坡)私人有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686 |
代理公司: | 北京世峰知识产权代理有限公司 11713 | 代理人: | 康健;王思琪 |
地址: | 新加坡*** | 国省代码: | 新加坡;SG |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 靶核酸序列 靶序列 扩增 检测 微生物 定量微生物 甲基化状态 试剂盒 无细胞 核酸 病毒 | ||
1.一种用于检测和/或定量从受试者获得的样品中微生物的靶核酸序列的存在的方法,所述方法包括扩增所述微生物的核酸的CpG岛中的靶序列,而不论所述CpG岛的甲基化状态如何。
2.如权利要求1所述的方法,其中所述靶序列处于所述微生物的核酸的CpG岛的核酸的5'末端内。
3.如权利要求1或2所述的方法,其中所述方法是聚合酶链反应(PCR)。
4.如权利要求3所述的方法,其中所述聚合酶链反应选自由以下各项组成的组:定量聚合酶链反应、数字聚合酶链反应、实时聚合酶链反应、以及传统聚合酶链反应。
5.如权利要求1至4中任一项所述的方法,其中从所述受试者获得的所述样品是血浆样品、血清样品或全血样品。
6.如权利要求1至5中任一项所述的方法,其中从所述受试者获得的所述样品包含cfDNA(无细胞DNA)。
7.如权利要求1至6中任一项所述的方法,其中所述微生物是病毒、细菌、真菌或寄生物。
8.如权利要求7所述的方法,其中所述微生物是病毒。
9.如权利要求7所述的方法,其中所述微生物是细菌。
10.如权利要求8所述的方法,其中所述病毒是埃-巴二氏病毒(Epstein-Barrr virus)(EBV)。
11.如权利要求10所述的方法,其中所述靶序列处于EBV的BamHI-W区域的CpG岛中。
12.如权利要求11所述的方法,其中EBV的BamHI-W区域的所述CpG岛选自由以下各项组成的组:
CTCCTCTCCAACCTTCGCTCCACCCTAGACCCCAGCTTCTGGCCTCCCCGGGTCCACCAGGCCAGCCGGAGGGACCCCGGCAGCCCGGGCGAGTCGCCTTCCCTCTCCCCTGGCCTCTCCTTCCCGCCTCCCACCCGAGCCCCCTCAGCTTGCCTCCCCACCGGGTCCATCAGGCCGGCCGGAGGGACCCCGGCGGCCCGGTGTCA(SEQ ID NO.:6);
AGGCCATGCGCGCCCTGTCACCAGGCCTGCCAAAGAGCCAGATCTAAGGCCGGGAGAGGCAGCCCCAAAGCGGGTGCAGTAACAGGTAATCTCTGGTAGTGATTTGGACCCGAAATCTGACACTTTAGAGCTCTGGAGGACTTTAAAACTCTAAAAATCAAAACTTTAGAGGCGAATGGGCGCCATTTTGTCCCCACGCGCGCATAATGGCGGACCTAGGCCTAAAACCCCCAGGAAGCGGGTCTATGGTTGGCTGCGCTGCTGCTATCTTTAGAGGGGAAAAGAGGAATAAGCCCCCAGACAGGGGAGTGGGCTTGTTTGTGACTTCACCAAAGGTCAGGGCCCAAGGGGGTTCGCGTTGCTAGGCCACCTTCTCAGTCCAGCGCGTTTACGTAAGC(SEQ ID NO.:7);
CTGGTATAAAGTGGTCCTGCAGCTATTTCTGGTCGCATCAGAGCGCCAGGAGTCCACACAAATGTAAGAGGGGGTCTTCTACCTCTCCCTAGCCCTCCGCCCCCTCCAAGGACTCGGGCCCAGTTTCTAACTTTTCCCCTTCCCTCCCTCGTCTTGCCCTGCGCCCGGGGCCACCTTCATCACCGTCGCTGACTCCGCCATCCAAGCCTAGGGGAGACCGAAGTGAAGGCCCTGGACCAACCCGGCCCGGGCCCCCCGGTATCGGGCCAGAGGTAAGTGGACTTTAATTTTTTCTGCTAAGCCCAACACTCCACCACACCCAGGCACACACTACACACACCCACCCGTCTCAGGGTCCCCTCGGA(SEQ ID NO.:8);以及
CGAGGAGGCGCCCGGAGTGGGGCCGGTCGGCTGGGCTGGCCGAGCCCGGGTCTGGGAGGTCTGGGGTGGCGAGCCTGCTGTCTCAGGAGGGGCCTGGCTCCGCCGGGTGGCCCTGGGGTAAGTCTGGGAGGCAGAGGGTCGGCCTAGGCCCGGGGAAGTGGAGGGGGATCGCCCGGGTCTCTGTTGGCAGAGTCCGGGCGATCCTCTGAGACCCTCCGGGCCCGGACGGTCGCCCTCAGCCCCCCAGACAGACCCCAGGGTCTCCAGGCAGGGTCCGGCATCTTCAGGGGCAGCAGGCTCACCACCACAGGCCCCCCAGACCCGGGTCTCGGCCAGCCGAGCCGACCGGCCCCGCGCCTGGCGCCTCCTCGGGGCCAGCCGCCGGGGTTGGTTCTGCCCCTCTCTCTGTCCTTCAGAGGAACCAGGGACCTCGGGCACCCCAGAGCCCCTCGGGCCCGCCTCCAGGCGCCCTCCTGGTCTCCGCTCCCCTCTGAGCCCCGTTAAACCCAAAGAATGTCTGAGGGGAGCCACCCTCGG(SEQ ID NO.:9)。
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