[发明专利]一种特异性引物检测鼠源性成分的方法在审
申请号: | 201710014015.7 | 申请日: | 2017-01-10 |
公开(公告)号: | CN106636421A | 公开(公告)日: | 2017-05-10 |
发明(设计)人: | 王学政;季福玲;鲁艳芹 | 申请(专利权)人: | 青岛正方元信公共卫生检测有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 青岛高晓专利事务所37104 | 代理人: | 白莹,于正河 |
地址: | 266109 山东省青岛*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 特异性 引物 检测 鼠源性 成分 方法 | ||
1.一种特异性引物检测鼠源性成分的方法,其特征在于工艺过程分为特异性引物设计合成、DNA提取、反应体系建立、PCR扩增、鼠源性成分分析结果评价五个步骤:
(1)、特异性引物设计合成:根据Genbank中鼠的线粒体细胞色素b基因序列设计并合成特异性引物,特异性引物的上游引物F的碱基序列为5’-GCCTTATAATTAATTGGAGGTA-3’,特异性引物的下游引物R的碱基序列为5’-AGCTATATTATGTGCTTGAT-3’;
(2)、DNA提取:取鼠肌肉组织1g研磨成糜状,然后按照组织基因组DNA提取试剂盒使用说明操作,提取DNA,经核酸蛋白分析仪测定提取的DNA的浓度为220ng/μL,纯度为1.85,用RNase/DNase-free H2O将提取的DNA浓度稀释为5ng/μL,备用;
(3)、反应体系建立:以步骤(2)提取的DNA为模板,用特异性引物建立10μL的PCR反应体系,取体积为2μL和浓度为5ng/μL的DNA模板、体积为1μL和浓度为5μM的上游引物F、体积为1μL和浓度为5μM的下游引物R以及体积为5μL的2×Master mixture,剩余部分用RNase/DNase-free H2O补足,实现反应体系的建立,并设置平行试验;
(4)、PCR扩增:将步骤(3)建立的反应体系置于实时荧光定量PCR仪上,设置以下条件:①、模板变性:95℃-5min;②、QPCR扩增:95℃-20s,60℃-10s,72℃-10s,40个循环,在72℃时采集荧光信号;③、熔解曲线:95℃-5s,65℃to 97℃的速率为0.5℃/5s,1个循环;
(5)、鼠源性成分分析结果评价:测定并加权计算实时荧光定量PCR产物平均Cp值,Cp值小于33,熔解曲线显示有明显的单一主峰,无非特异性PCR产物,表明利用该特异性引物能够检测到鼠源性成分,且特异性和重复性良好。
2.根据权利要求1所述的特异性引物检测鼠源性成分的方法,其特征在于所述特异性引物根据Genbank中鼠的线粒体细胞色素b基因序列设计并合成的,所述特异性引物的上游引物F的碱基序列为5’-GCCTTATAATTAATTGGAGGTA-3’,所述特异性引物的下游引物R的碱基序列为5’-AGCTATATTATGTGCTTGAT-3’。
3.根据权利要求1所述的特异性引物检测鼠源性成分的方法,其特征在于特异性引物的碱基序列是由上海捷瑞生物工程有限公司合成的;实时荧光定量PCR仪为Roche生物科技公司生产的LightCycler 480式实时荧光定量PCR;核酸蛋白分析仪为Biochrom有限公司生产的BioDrop-μLite式核酸蛋白分析仪;高速冷冻离心机是湖南湘仪实验设备有限公司生产的台式高速冷冻离心机;2×Mastermixture为Roche生物科技公司生产的LightCycler480SYBR Green I Master;DNA提取试剂盒为天根生化科技有限公司生产的组织基因组DNA提取试剂盒。
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