[发明专利]用于检测金针菇表面乳球菌的LAMP引物及检测方法有效

专利信息
申请号: 201710017369.7 申请日: 2017-01-11
公开(公告)号: CN106755463B 公开(公告)日: 2020-08-04
发明(设计)人: 王琼英;黄晨阳;陈强;高巍;赵梦然;曲积彬 申请(专利权)人: 中国农业科学院农业资源与农业区划研究所
主分类号: C12Q1/6844 分类号: C12Q1/6844;C12Q1/689;C12Q1/04;C12N15/11
代理公司: 北京安度修典专利代理事务所(特殊普通合伙) 11424 代理人: 胡长远
地址: 100081 北*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 用于 检测 金针菇 表面 球菌 lamp 引物 方法
【权利要求书】:

1.用于检测金针菇表面乳球菌的LAMP引物组,其特征在于所述的引物组由两个外引物,两个内引物和两个环引物组成;其中所述的两个外引物为:

F3:5’-TGTTTTTCAGACTCTACGTATG-3’(SEQ ID No.1),

B3:5’-ACGTGGTTATGGTACAACTT-3’(SEQ ID No.2);

所述的两个内引物为:

FIP:5’-ACACGAATTCGCAACAATCCCT-GGCAATTCCTTTAACCGC-3’(SEQ ID No.3),

BIP:5’-TTGAATTGAAGTCACAGCAGCA-AGGTAACTCTCTGCGTCG-3’(SEQ ID No.4);

所述的两个环引物为:

LF:5’-GCGTACGTGAAGATGTCATCCAAA-3’(SEQ ID No.5),

LB:5’-CCAGGAAGTGATGACAAAAGGA-3’(SEQ ID No.6);

所述的金针菇表面乳球菌是指乳酸乳球菌霍氏亚种(Lactococcus lactis subsp.hordniae)菌株或乳酸乳球菌乳酸亚种(Lactococcus lactis subsp. lactis)菌株。

2.用于检测金针菇表面乳球菌的LAMP检测试剂盒,其特征在于包括权利要求1所述的LAMP引物组。

3.根据权利要求2所述的LAMP检测试剂盒,其特征在于还包括:链置换型DNA聚合酶、反应缓冲液,荧光试剂,去离子水;阴性对照模板,阳性对照模板。

4.根据权利要求3所述的LAMP检测试剂盒,其特征在于所述的反应缓冲液包括:pH为8.8的20mM Tris-HCl,10mM KCl,10mM (NH4)2SO4,0.1% Tween 20,0.8M 甜菜碱,8mMMgSO4,1.4mM dNTPs;所述的阴性对照模板是指去离子水DW;所述的阳性对照模板是指PCDNA。

5.权利要求1所述的LAMP引物组在检测金针菇表面乳球菌上的应用;所述的金针菇表面乳球菌是指乳酸乳球菌霍氏亚种(Lactococcus lactis subsp. hordniae)或乳酸乳球菌乳酸亚种(Lactococcus lactis subsp. lactis)。

6.权利要求2~4任一所述的LAMP检测试剂盒在检测金针菇表面乳球菌上的应用;所述的金针菇表面乳球菌是指乳酸乳球菌霍氏亚种(Lactococcus lactis subsp. hordniae)或乳酸乳球菌乳酸亚种(Lactococcus lactis subsp. lactis)。

7.利用权利要求1所述的LAMP引物组检测金针菇表面乳球菌的方法,其特征在于包括如下步骤:

(1)提取待测金针菇表面菌总DNA;

(2)配制反应液:LAMP反应体系25µl:2×RM 12.5µl,1.6µM内引物FIP和BIP各2µl,0.2µM外引物F3和B3各0.25µl,0.8µM环引物LF和LB各1µl,荧光试剂钙黄绿素 1µl,BstDNA聚合酶1µl,待测样品DNA 2µl,去离子水DW 2µl;阴性对照模板为去离子水DW 2µl,阳性对照模板为PC DNA 2µl;其中RM为:含pH为8.8的20mM Tris-HCl,10mM KCl,10mM (NH4)2SO4,0.1%Tween 20,0.8M 甜菜碱,8mM MgSO4,1.4mM各dNTPs;

(3)在63℃下恒温反应1h,然后在85℃下5min结束反应;

(4)肉眼观察反应液颜色变化,如果反应液为橙色,说明没有乳球菌;如果反应液为绿色,说明存在乳球菌;或者在凝胶成像仪下观测,有荧光的,说明存在乳球菌;没有荧光的,说明没有乳球菌;

所述的乳球菌是指乳酸乳球菌霍氏亚种(Lactococcus lactis subsp. hordniae)或乳酸乳球菌乳酸亚种(Lactococcus lactis subsp. lactis)。

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