[发明专利]一种可视化标记基因组位点的方法有效
申请号: | 201710047040.5 | 申请日: | 2017-01-22 |
公开(公告)号: | CN106800602B | 公开(公告)日: | 2020-05-01 |
发明(设计)人: | 刘光慧;曲静;任若通;邓丽萍 | 申请(专利权)人: | 中国科学院生物物理研究所 |
主分类号: | C07K19/00 | 分类号: | C07K19/00;C12N15/62;C12N15/85;C12N15/65 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅;白艳 |
地址: | 100101*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 可视化 标记 基因组 方法 | ||
1.一种用于可视化标记基因组位点的试剂盒,为如下1)-8)中任一种:
1)包括融合蛋白,所述融合蛋白包括用于识别或结合基因组靶序列的转录激活样效应元件蛋白TALE和硫氧还蛋白TRX;
2)包括融合蛋白,所述融合蛋白包括用于识别或结合基因组靶序列的转录激活样效应元件蛋白TALE、荧光蛋白和硫氧还蛋白TRX;
3)包括蛋白组合物,所述蛋白组合物包括用于识别或结合基因组靶序列的转录激活样效应元件蛋白TALE和硫氧还蛋白TRX;
4)包括蛋白组合物,所述蛋白组合物包括用于识别或结合基因组靶序列的转录激活样效应元件蛋白TALE、荧光蛋白和硫氧还蛋白TRX;
5)编码所述融合蛋白的DNA分子;
6)编码所述蛋白组合物的DNA分子;
7)包括表达1)或2)所述融合蛋白的载体;
8)包括表达3)或4)所述蛋白组合物的载体。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:
所述靶序列为端粒DNA、着丝粒DNA、核仁组织区核糖体RNA编码基因或MUC4蛋白编码基因;
或所述端粒DNA的靶序列为序列14;
或所述着丝粒DNA的靶序列为序列15;
或所述核仁组织区核糖体RNA编码基因的靶序列为序列16;
或所述MUC4蛋白编码基因的靶序列为序列17。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:
用于识别或结合基因组中所述端粒DNA的靶序列的融合蛋白为a1)或a2);
a1)由核定位序列、用于识别或结合基因组中端粒DNA的靶序列的转录激活样效应元件蛋白TALE和硫氧还蛋白TRX融合得到的蛋白质;
a2)由核定位序列、用于识别或结合基因组中端粒DNA的靶序列的转录激活样效应元件蛋白TALE、荧光蛋白和硫氧还蛋白TRX融合得到的蛋白质;
或用于识别或结合基因组中所述着丝粒DNA的靶序列的融合蛋白为a3)或a4);
a3)由核定位序列、用于识别或结合基因组中着丝粒DNA的靶序列的转录激活样效应元件蛋白TALE和硫氧还蛋白TRX融合得到的蛋白质;
a4)由核定位序列、用于识别或结合基因组中着丝粒DNA的靶序列的转录激活样效应元件蛋白TALE、荧光蛋白和硫氧还蛋白TRX融合得到的蛋白质;
或用于识别或结合基因组中所述核仁组织区核糖体RNA编码基因的靶序列的融合蛋白由核定位序列、用于识别或结合基因组中核仁组织区核糖体RNA编码基因的靶序列的转录激活样效应元件蛋白TALE、荧光蛋白和硫氧还蛋白TRX融合得到的蛋白质;
或用于识别或结合基因组中MUC4蛋白编码基因的靶序列的融合蛋白由核定位序列、用于识别或结合基因组中MUC4蛋白编码基因的靶序列的转录激活样效应元件蛋白TALE、荧光蛋白和硫氧还蛋白TRX融合得到的蛋白质。
4.根据权利要求1-3中任一所述的试剂盒,其特征在于:
所述荧光蛋白为EGFP蛋白或mCherry蛋白;
a1)中所述融合蛋白的氨基酸序列为序列4;
a2)中所述融合蛋白的氨基酸序列为序列7;
a3)中所述融合蛋白的氨基酸序列为序列5;
a4)中所述融合蛋白的氨基酸序列为序列8;
用于识别或结合基因组中所述核仁组织区核糖体RNA编码基因的靶序列的融合蛋白的氨基酸序列为序列10;
用于识别或结合基因组中所述MUC4蛋白编码基因的靶序列的融合蛋白的氨基酸序列为序列12。
5.权利要求1-4中任一所述的试剂盒或权利要求1-4中任一所述的试剂盒中的融合蛋白或权利要求1-4中任一所述的试剂盒中的蛋白组合物在基因组可视化中的应用;所述应用为非疾病诊断和治疗的应用;
或权利要求1-4中任一所述的试剂盒或权利要求1-4中任一所述的试剂盒中的融合蛋白或权利要求1-4中任一所述的试剂盒中的蛋白组合物在制备基因组可视化的产品中的应用。
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