[发明专利]一组用于头颈鳞状细胞癌淋巴结转移速检的LAMP引物组CK19-146有效

专利信息
申请号: 201710051040.2 申请日: 2017-01-23
公开(公告)号: CN106701974B 公开(公告)日: 2020-10-16
发明(设计)人: 邰隽;倪鑫;韩阳;葛文彤;张杰;张亚梅;王生才;房居高;陈晓红;钟琦;李平栋 申请(专利权)人: 首都医科大学附属北京儿童医院
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6844;C12N15/11
代理公司: 北京市诚辉律师事务所 11430 代理人: 唐宁;梁婧文
地址: 100045 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一组 用于 头颈 细胞 淋巴结 转移 lamp 引物 ck19 146
【说明书】:

发明筛选出用于快速检测HNSCC淋巴结转移的特异性标志物基因及其基因组合,即CK7、CK19、CK7+CK19;建立了HNSCC患者淋巴结快速检测技术体系,即应用RT‑LAMP法进行淋巴结状态检测;可将整个实验过程控制在四十分钟左右。本发明所述检测方法耗费时间短,实验温度低、结果准确性高且判读方式简便。以RT‑LAMP技术为基础建立的HNSCC淋巴结快速诊断体系,使此类患者术中快速判定其淋巴结转移状态成为可能。

技术领域

本发明属于生命科学与临床医学领域。更具体的,本发明涉及用于头颈鳞状细胞癌淋巴结转移速检的LAMP引物组,以及头颈鳞状细胞癌淋巴结转移的临床、尤其是术中快速检测方法。

背景技术

头颈鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)在全球癌症发病率中排第六位,全世界每年有近65万新增病例,近年来恶性肿瘤诊治手段日新月异,然而HNSCC的5年生存率并没有明显提高。HNSCC治疗方案的选择及预后判断主要取决于TNM分期以及组织学分级,其中颈淋巴结转移情况对预后的影响较大。临床上约47%的HNSCC患者就诊时已经伴有颈淋巴结转移。因此颈淋巴结转移的准确检测对于HNSCC选择合理的治疗方案以及个体预后至关重要。

目前国内外颈淋巴结的转移状态主要依赖于局部触诊、影像学检查、病理检查等临床诊断手段。尽管随着超声、CT、MRI、PET、超声引导细针穿刺细胞学检查、术中冰冻切片病理检查等诊断技术的不断发展,颈淋巴结转移在术前术中诊断方面已有了一定进步,但迄今为止尚没有一种方法的诊断正确率能够完全满足临床需要,对于直径小于2mm的微转移灶更是无法准确检测。由于术前术中诊断手段较为局限,目前有10%~20%术前临床诊断为颈淋巴结转移阳性(clinical N+,cN+)的患者,术后病理检查未发现淋巴结转移,而同时约有25%术前临床诊断为颈淋巴结转移阴性(clinical N0,cN0)的患者术后病理却为淋巴结转移阳性。对于这1/4的cN0患者如果进行随访观察,患者将面临治疗不充分而带来的巨大风险;而对于另3/4的cN0患者和前述部分cN+患者,额外的治疗则完全没有必要,过度治疗带给患者的只有治疗风险和生活质量下降。

现已有研究开始探索分子生物学检测技术,即通过逆转录-多聚酶链反应(qRT-PCR)检测上皮来源特异mRNA的表达来判断淋巴结的转移状态。但常规的qRT-PCR分析一般需要3-4个小时的时间,不利于术中进行,因此临床特别需要一种能够准确、快速检测颈淋巴结状态的分子生物学方法。

发明内容

为解决上述技术问题,填补现有技术空白,本发明在初步筛选出与HNSCC颈淋巴结转移相关的特异性分子标志物的基础上,建立了头颈部鳞状细胞癌颈淋巴结转移术中快速检测方法,即应用RT-LAMP检测方法进行检测,在手术过程之中即可判断淋巴结的转移状态,指导术中治疗,确立有效、快速、低廉的检测方法;不仅为肿瘤诊断的研究提供新的依据,而且能够有效减少患者的痛苦,提高患者的预后,也可以大幅节省患者和医院的开支,具有非常重要的临床和社会意义。

本发明具体技术方案如下:

1、收集手术切除的新鲜标本:组织标本切取后,向临床医师确定肿瘤部位、范围及肉眼可以判别的浸润情况,并进行描述和详细的临床记录。

2、筛选HNSCC淋巴结转移特异性标志物基因:通过文献报道和检索数据库确定检测HNSCC淋巴结转移的可能mRNA标志物。检索来源包括:PubMed、OMIM、UniGene、GeneCards、CGAP。共预选出39个候选基因。使用qRT-PCR实验对上述候选基因进行2轮筛选:

1)第一次基因筛选:选择原发HNSCC患者19例肿瘤组织和非癌患者的15例良性淋巴结组织,非癌患者的诊断分别为:11例诊断结节性甲状腺肿、2例诊断颈动脉体瘤、1例诊断先天性甲状舌管囊肿、1例诊断头颈部皮下囊肿。应用qRT-PCR法分析上述39个候选基因,选取明确差异表达的4个基因(CK7、CK19、EGFR、TACSTD1)用于后续研究;

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